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行政事业单位支出管理是依据现行财政经济制度规定、有关的行政事业开支标准、批准的行政事业单位预算和其他有关法律法规，对行政事业单位支出的项目、范围和标准等进行规范管理，将行政事业单位的财务行为限定在法律法规许可的范围内，督促各行政事业单位合理、节约使用资金，少花钱多办事，实现单位绩效最大化。
政府的许多职能是通过行政事业单位来完成的，行政事业单位支出管理是降低政府行政成本的重要保障。要真正提高财政资金的使用效益，实现政府支出目的，必须要加强对行政事业单位的支出管理，将支出结构、规模与事业发展计划和行政任务结合起来制定综合定额标准，严格按定额进行支出，减少浪费。行政事业单位支出，既要保证社会公共事务管理的需要，又要遵守各项财政财务制度，精打细算，厉行节约，使各项支出发挥最大的效果，一般须要遵循以下原则。
(一)严格执行国家的财政财务制度
在我国，关于行政事业单位各项资金的使用范围、开支标准、定员定额情况等，都有相关的规定。行政事业单位要严格执行国家的财政财务制度和开支范围、标准，行政事业单位要建立健全必要的支出管理制度和手续，分清各种支出的界限，按照批准的预算和经费支出范围办理，严格审批手续，不得以领代报、以拨列支。无明文规定的开支项目，要报经上级有关部门批准后执行。
(二)统筹兼顾保证重点，合理安排支出比例
行政事业单位在安排支出原则与我国财政资金安排原则一致，即是统筹兼顾、保证重点，合理安排支出比例。对于各种重点项目、急需项目要在照顾一般的条件下优先安排，重点保障。在行政事业单位支出中，维持性支出和发展性支出并存，经常性支出和项目性支出共有，都需要安排，都需要资金，这就要求各行政事业单位合理调整安排资金，统筹兼顾，量力而行，分清轻重缓急，集中财力办事业，保证行政事业任务顺利完成。
(三)分清经费渠道，划清资金界限
行政事业单位的资金渠道较多，资金性质比较复杂，即使是财政资金，又有日常经费资金和专项经费资金，专项经费又因行政事业任务不同而需要单独核算单独管理。因此行政事业单位要根据资金的不同渠道，把基本业务支出、专项资金支出、基本建设支出和其他支出严格区分开来，按规定的用途使用，不得挪用挤占。
(四)加强政府采购管理，节约各种费用支出
政府采购是使用政府的财政性资金按照法定的方式和程序，为政府部门及其所属公共部门购买物资、工程或者服务的行为。它是财政支出方式的市场化，是财政管理与市场机制的有机结合。由于政府采购公开透明，并以竞争的方式作为实现采购目的的主要手段，而竞争是在开放的市场中实现效益最大化的有效途径，因此为行政事业单位节约支出费用提供了可能。
行政事业单位要加强政府采购管理，扩大政府采购项目范围，提高采购活动的透明度，便于纳税人监督公共资金的使用状况，提高资金使用效益。
第一，遵守国家有关财务规章制度，严格按照批准的支出预算执行。在支出管理中，行政事业单位要以国家规定的财务制度为行为准则，严格按照国家规定的开支范围和开支标准办理各项支出，不得任意扩大开支范围和擅自提高开支标准；要按照批准的支出预算以及规定的开支范围和开支标准合理安排各项支出，防止和纠正无预算、超预算支出，保证人员经费和单位正常运转必需的开支。
第二，健全规章制度，完善监督约束机制。有章可依、照章办事，是行政事业单位支出管理的重要环节。行政事业单位应建立健全一整套行之有效的财务管理制度。一是综合性管理制度，如各项经费支出管理制度。二是单项的管理制度，加强办公费、邮电费、差旅费、会议费、水电费、招待费、车辆维修费、设备购置费的管理制度。三是相关的管理制度，如接待制度、车辆管理制度等。
第三，各项支出要全部纳入单位预算，统一核算和管理。行政事业单位应将来自不同资金来源渠道形成的支出，全部反映在单位预算中，统筹安排各项支出，做到用之合理，减少支出的盲目性和损失、浪费、提高单位各项资金的综合使用效益。
第四，厉行节约，加强经费开支的计划性，优化支出结构。行政事业单位在支出管理中，一方面要精打细算、厉行节约，杜绝铺张浪费、大手大脚花钱的现象，以较少的资金消耗，办理更多的事情；另一方面要从优化支出结构入手，加强经费开支的计划性。随着公共事业的发展，行政事业单位的工作任务越加繁重，开支项目也H益增多，因此，要特别强调开支的计划性，以便使用较少的资金来保证工作任务的顺利完成。
第五，做好财务管理的基础工作，强化经费开支的日常管理。第一，按照有关财务规定，严格审批制度。每一次开支，都必须严格按规定的权限审批后才准予实施。第二，完备财务报销手续。每一笔开支必须具有合理、合法的原始凭证，并附有关批件，经办人签字，否则不予报销。第三，加强财产物资的管理。主要是加强各种材料、低值易耗品的日常细化管理，杜绝铺张浪费现象发生。
第六，加强资金使用效率的考核与检查，强化财务管理监督控制职能。由于各行政事业单位的业务性质不同，不能单凭预算金额超支或节约的绝对额来衡量评价其业绩，而应该结合业务工作量指标和岗位责任制对目标的完成情况进行全面的衡量，以防止片面性。要从实际出发，从社会效益出发，选择一些比较恰当的并能综合反映工作数量和质量的指标，客观公正地评价资金使用效果。
1．人员支出管理
人员支出是指行政事业单位用于职工个人方面的费用开支。人员支出包括基本工资、补助工资、其他工资、职工福利费、社会保障费和助学金等支出。
(1)基本工资、补助工资和其他工资的管理。行政事业单位职工的工资性支出包括基本工资、补助工资和其他工资。
基本工资，是行政事业单位支付给工作人员报酬的主要形式，是按照国家统一规定的工资标准支付给行政事业单位工作人员的基本劳动报酬。补助工作，是指工资的补充和延伸，是对工作人员因工作性质、工作地区的特殊性或民族习惯的不同等原因而支付的补助以及由于价格因素、超额劳动等原因支付的补贴、奖金以及临时工的劳动报酬。其他工资，是指在基本工资、补助工资之外，发给行政事业单位在职人员的属于国家规定工资总额组成范围内的各种专业津贴、补贴、奖金等。
加强工资性支出的管理，主要应做好以下几方面工作：
第一，严格执行国家制定的人员编制制度。行政事业单位的人员编制是工资性支出管理的重要基础和依据，是直接影响工资性支出规模的主要因素。因此，行政事业单位必须加强人员编制管理、严格控制单位增员。未经机构编制主管部门批准，任何单位不得自行增加编制，更不得超过编制配备人员。
第二，加强工资基金的管理。行政事业单位必须严格执行国家有关工资基金管理制度，凡属国家规定的工资总额范围的报酬，均要纳入工资基金管理，并按照规定编制单位工资基金计划。工资基金计划报经有关主管部门批准后，由各有关开户银行按照核定的工资基金总额监督支付。
第三，严格执行国家有关工资、津贴、补贴等个人待遇的规定。行政事业单位应加强对工资性支出的管理，严格按照国家规定的发放范围和开支标准进行发放，任何单位和个人不得擅自扩大发放范围和提高开支标准。
(2)职工福利费的管理。职工福利费是指用于职工鼓励待遇、解决职工及其家属生、老、病、死等困难所支付的费用，包括拨交的工会经费、按标准提取的工作人员福利费、独生子女父母奖励费、公费医疗、未参加公费医疗单位的职工医疗费、职工死亡丧葬费、遗属生活困难补助等。
行政事业单位职工福利费的管理使用应按照规定标准提取，实行经费包干，节余留用，超支不补。职工福利费使用必须按照规定的范围、标准和职工的具体情况处理，个人补助一般要本人申请，群众评议，单位工会研究决定，领导批准。要做到实事求是，把钱用到最急需的地方。
(3)助学金的管理。助学金是指国家为帮助学生解决在校学习期间学习、生活困难，按照国家规定发给学生的学习和生活费用支出以及对优秀学生的奖学金，包括各类学校学生助学金、奖学金、研究生生活补助费、学生贷款、出国留学人员生活费等。
行政事业单位在助学金管理方面应注意以下事项：
第一，对不同性质的学校、专业，助学金发放的比例应按不同的规定严格执行，不得擅自扩大享受范围和比例，提高发放标准。
第二，助学金的发放必须保证全部用于解决学生本人的学习、生活困难，不得挪作他用。
第三，各学校在控制的享受比例内，根据学生家庭经济困难的程度，由本人申请，民主评定，避免平均主义。
(4)社会保障费的管理。社会保障费是指行政事业单位用于职工医疗、养老、待业、住房等方面的费用支出，包括离退休金、缴纳的各项社会保险费和住房公积金等。
在现代社会，社会保障支出成为社会公共需要的重要组成部分，是社会经济发展的“稳定器”。社会保障属于公共事业，行政事业单位要认真履行国家有关法律、法规的规定，及时、足额提取或缴纳、发放各种社会保障费。各单位在提取或发放有关费用时，既不能超标准提取，任意提高各项待遇标准，也不能任意压低社会保障待遇标准，侵害社会保障受益人的合法权益。各单位还要严格按照有关财务规章制度规定，正确列支社会保障费，既要有计划支付、保证合理合法有效使用、解决受益人的困难，又要节约资金。
2．公用支出管理
公用支出是指行政事业单位为了完成公共事业计划和工作任务，用于单位公共事务方面的费用开支，包括公务费、设备购置费、修缮费、业务费和其他费用。
(1)公务费的管理：公务费的管理包括对办公费的管理、邮电费的管理、会议费的管理、差旅费的管理和燃料费的管理。公务费开支项目繁多，涉及面广，且具有节约潜力大，管理弹性较大的特点。行政事业单位要加强公务费的管理，建立健全各项开支的规章制度，照章办事。在办理公务费支出时，要检查费用开支是否符合事业计划，是否符合预算和季度用款计划，不得办理无预算、超预算的支出；检查经费支出是否符合规定的开支标准，不得办理超标准开支；检查金额较大的经费支出是否按审批权限办理厂审批手续，对超越审批权限的开支，要坚决拒绝付款；检查每笔经费支出是否具备合法的原始凭证和经办、验收、保管、领用、主管人员等的签名。
对公务费中的一些支出较大的项目，比如，会议费、业务招待费、汽车燃料、修理费、电话费以及水电煤油等主要的一次性消耗物资，都要实行重点管理。
(2)设备购置费的管理：设备购置费，是指行政事业单位用于购置不够基本建设投资额度，但按照固定资产管理的各种设备的费用支出，包括办公用一般设备购置费，车辆购置费。车辆购置附加费，教学、科研、医疗单位的专业设备购置费，专业图书馆、文化馆的图书购置费．以及一般行政事业单位的图书购置费、档案设备购置费等。
行政事业单位购置的设备是行政事业单位业务工作的物质条件，设备购置费的管理应注意做好以下几方面的工作：
第一，划清基本建设投资与行政事业经费开支的界限。凡达到基本建设投资额度的设备．应该按照规定程序报计划部门从基本建设投资中解决；凡属于行政事业费列支的各种设备费用，应该从行政事业单位经费中解决。基本建设投资和设备购置基金，必须专款专用，不得挤占和任意挪用。
第二，合理配置，充分发挥设备的使用效率，既要保证业务需要，又要坚决贯彻节约原则，防止重购、盲目购进造成积压、浪费。应当充分利用现有设备，发挥其应有的作用。对确需购买的设备，应进行可行性分析论证。购置物质设备要求事先编制统购计划，应尽可能实施共同性设备共建共用，提高设备的利用率，减少资源浪费。
第三，执行社会集团购买力管理规定。属于国家专项控制的商品，必须报经社会集团购买力管理机构批准，严禁违反规定套购。
第四，在有条件的地区，设备的购置应一律实行政府采购。
(3)修缮费的管理：修缮费是指行政事业单位的公用房屋、建筑物及附属设备的修缮费用。它是行政事业单位用于恢复固定资产使用价值所支付的费用开支，包括房屋修缮费、公共设施修缮费和零星土建费。
行政事业单位对修缮费的管理，主要做好以下几方面工作：
第一，应严格划分一般修缮、大型修缮与基本建设项目的资金界限和审批权限。行政事业单位在管理工作中要注意划清界限，分别按照不同的资金来源渠道列支和管理，不得相互挤占、挪用。
第二，要节约使用修缮费。在修缮费使用上，要充分运用经济手段，通过公开招标等竞争方式．既保证修缮工程的质量，又节约修缮费开支。
第三，要认真审核和完善支出手续。修缮费用支出要认真审核，做到结算与实际相符、计算单价与国家定额标准或双方协议相符，运算准确。
(4)业务费的管理：业务费是指行政事业单位为完成专业活动所需的消耗费用开支和购置的低值易耗品支出。行政事业各单位由于业务性质不同，因而业务费的具体内容也不相同。
业务费是行政事业单位完成事业计划和工作任务的重要条件，行政事业单位应重点予以保证。由于行政事业各单位的业务工作差别较大，对于大多数业务费开支项目，国家没有制定具体的开支标准，各单位在执行中容易出现支出随意性的问题。因此，行政事业应根据本单位的实际情况和业务特点，制定各项业务费定额和相应的管理制度，合理使用资金。同时，要加强对业务费使用的监督检查，发现问题，及时纠正。
(5)其他费用的管理：其他费用，是指上述费用以外的费用开支，包括外籍专家经费、出国实习人员生活费、来我国实习人员生活费等。
行政事业单位在办理其他费用支出时，要按照国家有关规定执行，不符合国家规定的开支，不得办理支出。