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药剂管理是指医疗机构根据医疗、教学、科研工作的需要，对药品依法进行采购和保管，对药品和制剂进行科学调剂和配制，为预防、治疗、科研工作提供所需要的药品和制剂，确保人民用药安全、有效及教学、科研工作的顺利进行。
1.部分药剂人员的专业素质较低
一般的情况下，大多数人们会认为，药剂科只是一个窗口型的服务科室，药剂员只要按照医嘱为患者发放药品就行了，这就导致一部分药剂员忽视自身所需要的专业素质。但是，随着我国医药学的快速发展，很多新药品也不断地在临床中被应用与推广，药剂的管理工作也开始由传统的看方抓药向现代技术型过渡，医院的药学模式也过渡为了医药的结合与协作了。可是，还是有一部分药剂工作人员的观念已经僵化，在学习的道路上停滞不前，就连医院药剂室的人才引进和流动机制也不完善、健全，这些都在不同程度上制约这药剂员自身素质的不断提高。而且，由于当前药剂管理制度所存在的问题，所以许多药剂的管理工作都因为责任不明确，造成许多潜在的隐患。
2.临床药学发展速度缓慢
药剂科在开展药学研究的时候，会受到医生对研究项目的了解与重视程度、医院的钱物投入，医院整体的学术环境以及药剂学人员的专业素质等多项因素的制约，所以发展速度比较缓慢，管理水平也比较低下，不能准确地体现临床应用中药学的具体作用，也不能充分地展示药学的专业技能，所以，在研究中很多工作都不能按照正常程序进行。我国目前的临床药学应用水平有限，这就限制了药剂从供应型过渡到临床应用型，所以，药剂科的研究水平一直不能提高、进步。
3.部分药剂的质检工作不到位
现在我国大多数的药剂都可以在使用前被检验，但是各个药剂科所配制的药剂要做定量分析还是有很多差异的。现在，我国大多数医院对于灭菌制剂与滴眼剂都能按照规定的要求进行检查，但是，对于那些内服类地制剂，还不能进行完全的细菌检查，而且检验率的差别也很大。标准的含量测定手段一般都比较复杂、琐碎，甚至需要一些比较特殊的仪器进行检验。
1.完善药剂的管理程序
首先，要加强对药品购买的规范化管理，建立健全药品的采购制度。购买质量好、价格实惠的药品，以满足患者在临床用药中的需求。药剂科还要及时地掌握最新的医药信息，不断提高药剂科地生产能力。同时，还要制定科学、合理的购买计划，做好常规类药品和特殊类药品的采购，严把药品的采购关卡，要买的药品必须都具有营业执照和生产许可证等证件，确保药品质量的稳定性、以及价格的合理性，保证临床治疗和科研的顺利。药剂科还要明确药剂的责任管理制度，无论是从药品的采购，还是药品的发放环节，都要责任到人，到柜，并制定出对此过程进行监督的措施，保证各项制度的落实。
2.提高药剂员的业务素质
加强对药剂员基本业务素质与技能的培训，规范其操作并不断加强对新知识的学习，及时关注更新的信息，跟上新时代前进的步伐。在加强自身业务学习的时候，还要定期对药剂师进行业务上的考核，而且要把考核的成绩和药剂师的职称晋升和奖金等切身利益挂钩。此外，还要定期引进高素质人才，注重对所有员工的业务素质培养，丰富、更新他们的知识，促进药剂科整个科室业务的提高。
3.医院要加大对药剂科的支持力度
药剂科要获得上级支持与理解，配合上级的工作，不断突出药剂的重要性，制定一些科学、合理的发展方案，尽可能的争取到医院的人力与资金支持，此外，还要争取到一定的技术支持，同时要借助政策的支持，合理利用现有的资源，使资源效益可以达到最大化程度。
1.医院药剂科管理不断完善
新医改后，医药分家、医保等政策已在全国各地有效开展，医院药剂科的职能也将越来越明确，药剂科管理方面也需要根据职能变化做出不断调整。医院药品交易方面的不正之风会逐渐减少，药价稳定，老百姓“看病贵，买药难”的问题得到解决，老百姓利益得到保障。我国医院药剂管理主要向着几个方向发展：
(1)技术服务方面，药师在用药安全有效性和提供用药治疗指导方面的服务加强，药师的素质水平需要加强。
(2)药剂科的职能范畴拓宽，药剂科不仅仅局限于对于药品使用方面的工作，拓宽到对于医院药事管理工作和新药研发，临床用药管理等范畴。
(3)医院药剂科的管理应从药品供应型向医药结合协作，临床综合性服务转变。
2.扩大药师队伍，加强药师素质的培养
医院药剂科管理需要转型，需要顺应发展趋势，人员的素质要求不断提高，良好的服务质量和专业的技术水平离不开医院各级领导对于人才培养的重视，药师培养方面还需要与临床实际结合起来，了解病人用药的实际情况，重点抓紧临床药师培养。对于执业药师和临床药师的职责也越来越明确，在临床安全用药和药物治疗上的作用也将越来越高
3.医药信息化水平不断提高
以前在医药管理过程中信息量数据量大而人员方面限制易导致信息数据丢失或者错误，如今电子计算机技术的引进给医院药剂的信息化管理带来了极大的方便，方便快捷的信息系统使用促使工作效率不断提高，而药品采购，招投标等操作已逐渐实现网络化操作，不仅节省空间时间也使得药品采购更加公开化公平化。医药管理的信息化将成为未来发展的主要趋势。
随着医改的不断深入，医院药剂管理也在由单一的药房发药功能向一个综合部门转型，对于其服务的要求不断提高，对人员素质的要求也不断提高，医院药剂科必须加强科室内部建设，提高专业技术水平和服务水平，适应发展需求。