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药物治疗是指通过应用药物消除或控制病因与致病因素，缓解或治愈疾病、预防疾病发生或复发，提高患者的生活质量，是临床治疗的重要手段。
①确定适当的剂量、疗程与给药方案，才能使药物的作用发挥得当，达到治疗疾病的目的。
②在明确疾病诊断的基础上，从病情的实际需要出发，以循证医学为基础，选择适当的药物治疗方案。
③药物过度治疗是指超过疾病治疗需要，使用大量的药物，而且没有得到理想效果的治疗，表现为超适应症用药、剂量过大、疗程过长、无病用药、轻症用重药等。过度治疗的常见原因：患者求医心切；虚假广告泛滥，患者受诱惑；保护性的过度用药行为，处方追求“大而全”。追求经济利益
④治疗不足，表现为，剂量不够，达不到有效的治疗剂量；或疗程太短，达不到预期的治疗效果。引起治疗不足的原因主要有：患者对疾病认识不足，依从性差，未能坚持治疗；患者收入低，又没有相应的医疗保障，导致无力支付；国家基本药物政策还不完善，出现安全有效的基本廉价药因利润低，企业停止生产供应而缺货，影响了疾病的治疗。
药物在发挥防治疾病作用的同时，可能对机体产生不同程度的损害或改变病原体对药物的敏感性。保证患者的用药安全是药物治疗的前提。产生药物治疗安全性问题的原因：其一，药物本身固有的生物学特性。其二，药品质量问题。 其三，药物的不合理使用。
药物治疗的经济性（economy）就是要以消耗最低的药物成本，实现最好的治疗效果。药物治疗的经济性主要是指：
①控制药物需求的不合理增长，盲目追求新药、高价药。
②控制有限药物资源的不合理配置，资源浪费与资源紧缺。
③控制被经济利益驱动的不合理过度药物治疗。
在药物治疗方面，指南往往根据疾病的分型、分期、疾病的动态发展及并发症，对药物选择、剂量、剂型、给药方案及疗程进行规范指导。在针对某一具体患者时，既要考虑指南的严肃性，又要注意个体化的灵活性。