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企业自主机制指企业的自主性，即自主决策、自主经营、自我负责、自负盈亏的机制。
在旧的体制下，企业产权不清，并接受主管部门的直接领导，成为行政主管部门的附属物。在当时的条件下，企业当然没有自主性。这正是国有企业与市场经济之间的一大矛盾。为了解决这一矛盾，必须进行企业制度创新，建立现代企业制度。建立了现代企业制度，企业拥有了法人财产权，摆脱了政府行政干预，实行了政企分开，企业就有了自主性，可以自主经营、自负盈亏了。在新的企业制度下，企业自主机制就自然发挥作用。
自主机制是现代企业营运的核心机制，在企业营运中起主导作用。它是指在市场经济条件下，企业能自动地感觉市场信号，并能对其生产经营行为进行自动调节而不受外界非正常干扰的制度保障系统，也就是企业在责、权、利统一的条件下，保证经营自主权得以实现的条件、方法、手段的有机系统。
这里，我们首先要把企业自主机制和：企业经营自主权这两个概念澄清，经营自主权是一种经济现象，而自主机制是一种制度保障。我们所讲的企业“能自动感觉市场信号，并能对其生产经营行为进行自动调节”，正是企业自主经营权的体现。而企业自主机制所要解决的是用什么方法，用什么手段来实现企业的自主权。
广义的自主是人们能独立地表现自己的意愿并付诸行动的权利，而经济上的自主则来自于对物或财产的所有权，自主权利的最初来源应当说来自于所有权。在市场经济条件下，自主权表现为对企业财产的盈利为目的的经营权。
所有权与经营权(即自主权)可以是同一的，也可以是分离的。所有权同经营权的同一即直接结合，存在于生产社会化程度较低的时代，而在现代社会化大生产中，经营权与所有权相互分离，其现实性就在于两权分离更能适应社会化大生产的要求，适应市场经济发展的要求。
一方面来说，由于现代社会化大生产的连续性和复杂性以及社会需求的多变性和多样性，使企业的经营管理发生了质的变化，分散或者集中的生产资料所有者已经不能全面有效地指挥生产了，必须赋予直接经营者经营管理自主权，由技术型、专家型的管理者来组织生产经营，才能适应变化了的生产力状况。
另一方面，在现代化生产和市场经济条件下，要求对各种资源实行最优化配置，随之决定了企业的经营权必须由财产所有者直接经营转向由具有专门技术知识的经营人才经营管理，这样就形成了所有权与经营权的分离。
现代企业实行所有权与经营权的分离，主要存在于两种形式中，第一种形式是股份制企业，由于最终所有者特别分散，与社会化大生产不相适应，而采取股份制形式，交由专家型人才经营管理，实行两权分离，解决了这一矛盾。例如日本丰田公司，其股东超过四百万，股东的分散性相应的造成了所有权和经营权的分离，众多股东只能把自己的经营监督权委托给股东代表的组织董事会来完成。因而股份制企业这种形式为所有权和经营权的分离找到了规范化的好形式；第二种形式是最终所有者特别集中，所有者就是国家的国有企业，这些企业主要分布在能源、银行、原材料等部门。
在社会主义国家中，国有企业的分布就更为广泛。当国有企业作为政府干预、调节宏观经济的手段时，其赢利性就不是经营的直接目的，一些产品或服务对国家的政治、军事、经济来说有比利润更大的作用，由此政府倾向于凭所有权直接经营企业。问题是，国有企业只有一个产权主体，而直接管理众多企业，同样会力不从心，目前无论东方还是西方，国有企业都朝两权分离的方向发展，比如说法国的国有企业比重占的较大，处理国家和国有企业之间关系的基本原则是既要保证国家对企业的所有权和领导权，又要保证企业拥有经营自主权，让大多数国有企业象其它企业一样，按照一般经济法则和市场规律来进行。
综上所述，企业的所有权与经营权无论是一体化还是相分离，都是以追求盈利最大化为目标，究竟采取何种形式，则取决于当时当地的生产力状况。
自主机制的组成内容，也就是自主经营权在企业营运中不同层次、不同环节的表现，主要有：1.生产经营决策权。
它是企业自主经营权最核心的权利，在市场经济条件下，企业是直接为市场组织生产和服务的，企业和市场的唯一联系媒介是它的产品和服务，其产品和服务是否符合市场需要，取决于市场的选择，一旦企业生产的产品或服务水平不符合市场需要，无法被市场容纳，企业生产的产品和提供服务的劳动就变成无效劳动，企业不但不能获利，且得无偿消耗劳动，造成企业亏损，甚至破产，因此，企业确需有权依据市场信号自动地安排调整自己的生产经营内容。
2.产品销售权
这是企业生产经营权的延傅。产品销售权与生产权是紧密相联的，销售权来源于企业对自己生产的产品所拥有的权利，销售作为产品实现其价值的“跳跃”运动，对企业起至关重要的作用，企业的经营决策能否成功，均系于销售能否实现。因此，对于大多数根据市场作决策的企业来说，销售是决定企业命运的重要环节。另外外贸权也是销售权的一个重要组成部分，随着国际经济一体化进程的加快和国内法规的健全，外贸权将逐步扩大。
3.投资决策权。
企业的生产经营活动从资金运动过程看就是企业资金的增殖过程，根据市场状况企业可以进行简单再生产和扩大再生产，企业所拥有的投资决策权既配合着企业生产经营决策权的实现，又是企业法人所有权的体现，投资决策权充分地体现出企业对法人资产的处分权利。至于企业的投资权限，一方面要由靠企业自身的投资能力大小来确定，另一方面要看这个权限在多大程度上与国家、地方的有关政策、规划相容合或抵触。与决策权相对等的是企业也必须为相应的结果承担责任或分享收益。与投资权相关的财产处置权也是企业所必需的。当然，企业行使投资决策权及财产处置权必须保证经济合理，必须保证财产的最优配置。
4.企业产品定价权。
企业产品定价权反映着企业作为产品所有者的权利。同时，产品价格也是企业参与市场竞争的“指示器”和“杀手锏”，因而，企业必须具有独立完整的产品定价权，反对政府对企业产品或服务价格的不应有的管理，否则扭曲的价格就不能真实反映市场供求，最终导致国家经济结构的失衡和效率的降低。
价格决策权放在企业就使价格决策分散化，使价格的形成能更好地体现市场供求状况，有利于理顺价格关系，利于形成反映价格规律的价格机制。价格正确反映市场状况，才能为企业走向市场参与公平竞争，做到自负盈亏创造前提条件，所以说，企业拥有产品定价权，也是国家实施宏观间接管理的必要条件。
5.企业劳动人事与工资奖金分配自主权。
这个权利也是企业的所有权及生产经营权派生出来的，在生产资料私有制条件下，劳动力仅是被看作为生产中的一种投入要素，企业对劳动力的需求是由产品市场对企业生产的最终产品的需求所派生来的需求，使用这种要素的代价是给劳动者发放工资，工资是构成企业产品成本之一。因此，追求利润最大化的企业是尽可能使用自己的权利减少劳动量、压低工资，减少工资总额，降低产品成本，这种“自主”权利的使用范围和力度在动态的经济变化中不断调整。
就我国目前情况而言，落实企业自主经营权，建立起行之有效的企业自主机制需要企业内外各种条件的配合。从企业内部来说，要建立权责利相统一的责任制度及与这种责任制度相一致的内部权力机构。从外部来说，主要是规范政府行为，理顺政府和企业的关系，把管理权在政府和企业内进行科学界定，同时，积极培育和建立市场体系，为企业自主权的充分发挥提供良好的环境。