玄门丹药是道家外丹派传承，起源于道家黄白术。后因历来皇族信仰，成为金室秘藏，不被民间所识。而撑控外丹术技术者，则被皇帝赏识而归纳已用。自吾被师所受术之后，即了解外丹所造之精微，以吾所知者，乃言之于下。玄门丹药向被所秘，分为：玄门四大丹，玄门四小丹，玄门八宝，玄门八十一丹等等。每种丹药之制做较复杂，因为是汞砒制剂，所以历来对此都要求严格，现以玄门四大丹以示教：
玄门四大丹是道医丹医所习用的四大丹药，又称“四大金刚”，往往效果立竿见影，在中医界鲜有人知此内秘。后来因为传承变故，其中除“毒龙丹”流落民间之外，其他三大丹药皆未失传，都是在秘密的传承之中。
金龟下海丹
本方来源：玄门四大丹之一
组成：水银30，芒硝30，白矾30，皂矾20，硇砂25，白砒15，磁石20，雄黄30，朱砂30
主治：组织坏死，多年溃疡，顽固瘘管、痈疽、发背、痰核及疮疡破溃流脓或内有腐肉者，皆可一用。
混元丹
本方来源：玄门四大丹之一。
本方共分三组，类似玄门三打灵药。
第一组：水银60克，芒硝60克，白矾60克，皂矾60克，太阴元精石60克，朱砂60克，硫黄15克，雄黄15克，硼砂15克，硇砂9克。
第二组：水银60克，芒硝45克，白矾30克，太阴元精石30克，朱砂30克，硫黄15克，硼砂15克，硇砂9克。
第三组：芒硝21克，白矾21克，皂矾21克，硫黄9克，雄黄3克。
炼法：分成三转升炼。
第一转：除水银、朱砂、雄黄三味外，余七味共研入锅炒至老黄色时取出，加入后三味调合均匀入罐封固，用三文一武火炼之，共炼四炷香，火候准，足时后冷定取丹。
第二转：将二组药照前炒黄后，同一转升药研匀入罐封固，亦是用三文一武火而炼之。
第三转：将第三组药物同二转升药研匀，入罐封固，照一转法进行三打，三打毕取出丹药，储入瓶中封口，沉入井底，一同退火即可用。
用法：
1．凡风寒湿气留滞经络、筋骨疼痛者，以本丹9克，加乳香9克，没药9克，朱砂0.5克，麝香0.5克。酒糊为丸，如梧子大，每次服1～2丸，酒送下，每日3次。
2．腹中冷气久不愈者，以本丹9克，加高良姜3克，胡椒3克，共研末，每次以砂仁汤下1克即可，每日3次。
3．各种心痛、小腹疝气者，用砂仁30克，陈皮30克，醋炒香附30克，木香9克，炒小茴香30克，荔枝核30克，枳壳45克，沉香15克，加本丹9克，糊丸如梧子大，每次服6克，黄酒送服。
4．偏头痛：百药无效者，用炒白芷75克，川乌（半生半熟）30克，共研末，加入本丹3克，开水送服3克。
5．诸般腹痛：用乌药、香附各30克研为末，加本丹6克。每次服3克，开水冲服。
6．风寒痹痛：用续断12克，川乌、草乌各3克，防风9克，牛膝10克，煎水冲服，本丹每次3克。
7．妇女月经不调：用红娘子3克与米同炒，炒后去头足研为末，加本丹3克，每次服24克，红花汤调服，每日3次。体质虚弱者，则单用米即可。
8．黄水疮者，用煅石膏15克，煅龙骨15克，枯矾9克，松香9克，共研末，加入本丹3克，研匀，用蛋黄油调搽。
9．刀砍斧伤者：用生半夏末30克，本丹15克，研匀，开水调敷，即生肌收口，且愈后无瘢痕。
10．诸类湿疮：用松香60克，牡丹皮30克，炒铅粉15克，青黛60克，头发少许，一同煅枯为末，每30克中加本丹9克，以麻油或是蛋黄油调匀敷患处。
乾坤一炁丹
本方来源：玄门四大丹之一。