(一)医患双方协商解决，双方当事人在自愿的前提下可以自行协商解决，并签订协议书，双方当事人应当自觉履行协议书中的规定。
《医疗事故处理条例》第四十三条、第四十四条、第四十六条都有相关规定。一是医患双方自行协商解决。《医疗事故处理条例》第四十三条规定:“医疗事故争议由双方当事人自行协商解决的，医疗机构应当自协商解决之日起7日内向所在地卫生行政部门作出书面报告，并附具协议书。”此条规定是当事人自行协商解决医疗事故的法律依据。
这种解决方式的根本特点在于：当医疗纠纷发生后，患方和医方不要任何组织或个人介入其纠纷，只通过双方协商即可使纠纷得以化解。通过医患双方自行协商解决医疗事故纠纷已被实践证明是一种行之有效的方式。在医疗事故纠纷中，只要医患双方坚持实事求是的原则，在弄清事实、分清是非的基础上，自行协商解决医疗事故纠纷，既有利于双方互相谅解，不伤感情，减少精神损耗，又可以减少不必要的行政处理和诉讼程序，节省人力、物力和财力。这样做，最终有利于医疗事纠纷的及时解决，有利于维护医患双方的合法权益。
(二)申请医疗事故技术鉴定，当事人向医疗机构所在地的县(区)卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，卫生行政部门自收到医疗事故争议处理申请之日起10日内进行审查。对符合《医疗事故处理条例》规定的，予以受理，需要进行医疗事故技术鉴定的，移交全医学组织鉴定;对不符合条例规定的，不予受理。
卫生行政部门的处理。医疗事故发生后，当事人可申请卫生行政部门处理，对符合《医疗事故处理条例》规定条件的，卫生行政部门应及时受理;对需要进行医疗事故技术鉴定的应当交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定。此鉴定结论，既是对发生医疗事故的医疗机构和医务人员作出行政处理的依据，又是进行医疗事故赔偿调解的依据。卫生行政部门在坚持以事实为根据、以法律为准绳的基础上，通过说服双方当事人，促进协议的达成，使医疗纠纷得以解决，这就具有行政调解的性质;同时，卫生行政部门所作的处理决定，如果双方当事人在法定期限内对处理决定不提出异议，不向上级卫生行政部门提出复议申请，也不向人民法院提起诉讼，这个处理决定便产生法律效力，当事人应当执行。如果一方当事人不履行裁决中的有关义务，另一方当事人可以向人民法院申请强制执行。
(三)诉讼解决。所谓诉讼解决是指通过法院的审理来解决医疗事故纠纷。诉讼在处理医疗事故纠纷中的作用，随着社会的发展和人们法制观念的重视和提高，正变得越来越重要。
综合上面所说的，医疗事故发生之后就需要及时的处理双方的纠纷，一般可以选择先协商处理，只要协商处理好那么保障自己利益的时间会更快一些，但如果处理不好可以走法律的流程，只要有合法的证据，那么就可以保障到自己胜诉的权利。