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货运税控是指从事货物运输的试点一般纳税人，使用货物运输业增值税专用发票税控系统开具货物运输业增值税专用发票。
原公路、内河货物运输自开票纳税人认定为增值税一般纳税人后，可从以下两种方式中选择使用货运税控系统：
一是凭在用的税控盘和报税盘到主管国税机关办理重新发行后继续使用。重新发行前，纳税人应先到主管地税机关办理营业税税款清缴、未使用完发票注销和税控盘、报税盘注销等手续；
二是向货运税控系统服务单位购买使用。
原增值税一般纳税人兼有货物运输服务的,也需使用货运税控系统开具货运专用发票。
税控开票业务流程如下：
（1）纳税人购置税控装置
按税务机关要求，纳税人购买税控盘和传输盘。
（2）注册登记
税务机关受理纳税人提交的有关文书，对其进行审核、批准，在管理系统中登记其基本信息和税务机关核准信息，并对相应税控盘和传输盘进行初始化。
（3）购票信息写盘
用户登记注册后，还需要购买发票并进行购票信息写盘，才能正常开票。购票信息写盘是对纳税人已购税控发票信息进行确认后写入税控盘或传输盘中。
（4）日常开票
用户在完成上述流程后，使用本开票系统即可进行正常开票操作。开票周期可以通过税控盘或传输盘回传监控数据来控制。
（5）纳税人开票信息申报
到税务机关指定报税时间后，纳税人将税控盘中的开票信息形成申报数据，用税控盘或传输盘到税务机关申报纳税。
（6）税务机关接收申报数据
税务机关从税控盘或传输盘中读出抄报数据，并将监控数据和新的购票信息写入税控盘或传输盘。