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职能创新就是在计划、组织、控制、协调等管理职能方面采用新的更有效的方法和手段。我国企业技术落后，管理更落后，因此职能创新任务紧迫。
企业职能创新是企业经营战略适应自身成长和市场发展要求的根本保障。根据企业组织结构形成的变迁可知，企业职能由作业职能向经营管理职能和服务性职能转化，并且在分工领域出现了水平和垂直分工的分化。这一切都说明了在企业的变化发展过程中，企业的职能创新主要表现为管理职能的创新。比如，对应于市场发展而言，企业通过业务调整和拓展来满足需求的变化要求，这时，企业的职能创新集中表现为业务职能的创新。
企业的边界和范围具有动态性，其发展有张有弛。企业边界和范围的每一次变动，也都伴随着企业组织职能创新活动的发生。因此，要保证企业经营战略的有效性，就必须在确立价值创造的企业目标、准确把握机会的同时，不断地进行与之相应的企业职能的创新。
1、计划的创新。许多企业在计划工作中运用运筹学取得显著成效，例如，华北油田电厂从1997年开始在购电、电网运行和用电方面采用目标规划，使油田用电费用年节约额达2000万元以上。
2、控制方式的创新。例如，丰田公司首创准时生产制（JIT），显著降低了成本；潍坊亚星化工集团采用购销比价管理，加强购销环节监控，5年增收节支7092万元。
3、用人方面的创新。例如，应用测评法招聘选拔和考核干部员工，采用拓展训练等方法改善培训效果等。
4、激励方式的创新。例如，美国企业实行“自助餐式”的奖励制度，使同样的支出获得更好的激励效果。
5、协调方式的创新。1999年，福建南平市政府试行科技特派员制度，他们通过调查，了解村镇和农业大户需要哪些技术支持，同时将全市3500名农业科学技术人员按专长分类公布，然后将两者对接起来，实行双向选择，结果农户收入和农业科技部门、农业技术人员的收入都大幅度增加。
实际上，由于管理职能互相渗透，有些创新很难归入哪一种，如PERT既是计划新方法，又是控制新方法（重点环节控制）；目标管理既是计划新方法，又是激励、协调新方法；TQC小组既是控制新方法，又是组织和激励新方法。