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网上抄报税是指将企业的防伪税控开票子系统存根联明细数据信息形成电子数据，通过互联网报送至国税机关，由国税机关进行数据接收，经国税机关一窗式申报比对成功后通过网络回传清卡授权，企业自行清卡的一种IC卡报税方式。
纳税人通过防伪税控开票金税卡自行完成抄税操作后，运用网上抄报税软件通过网络将报税数据传输到税务机关，由税务端网上报税系统自动完成报税数据解密、报税业务处理、发票比对等处理工作，企业再通过网络查询报税结果信息，并在报税成功、增值税“一窗式”比对通过且缴纳税款的情况下进行清卡操作。
网上抄报税系统是以增值税防伪税控系统为基础，由企业用户通过各自的开票金税卡自行完成抄报税操作，将报税数据通过INTERNET网络传输到税务机关，由税务机关完成数据解密、业务处理、发票比对等处理工作，最后企业再通过网络查询报税处理的结果信息，在报税成功的情况下进行清卡操作，完成整个报税过程。该系统由税局的报税服务器和报税工作站、互联网的公网服务器和企业客户端软件三大部分组成（重点是企业客户端软件）。
网上抄报税系统企业端是由企业端软件、开票金税卡、小读卡器和税控IC卡组成的。主要用于从企业税控IC卡中读取报税数据，在进行加密封装后，向公网服务器上传，并能查询企业相应税控IC卡的报税结果信息，在报税成功后进行清卡操作，以便能够继续开票。
1.运用网上申报软件，发送申报数据。
3.申报表审核成功后，税务局端自动扣缴税款。
4.如自动扣缴不成功或未存入足额的税款，待存入足够税款后，再次运用网上申报软件扣缴税款。
5.扣款成功后，运用网上抄报税系统查询结果，系统提示报税结果为报税成功后，进行清卡操作。