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一窗式管理是指增值税纳税申报纳税的一窗式管理,其核心内容是纳税人可以在同一窗口统一办理防伪税控IC卡报税、专用发票抵扣联认证和纳税申报。实行一窗式管理后,纳税人原来需在报税、认证、申报等多个窗口、多个环节分别办理有关手续的过程大大简化,简便了纳税程序,提高了办税效率,进一步方便了纳税人,优化了纳税服务。
实施增值税一般纳税人纳税申报一窗式管理，是国家税务总局近期推出的一项改革创新举措。一窗式管理工作的核心是通过对增值税一般纳税人申报的进项抵扣数与金税认证数，申报的销项数与金税抄报数通过计算机进行实时比对。旨在切实加强增值税的征收管理，堵塞漏洞，优化纳税服务，提高办税效率，为纳税人营造更好的纳税申报环境和集约的申报方式。
其作用在于：
1、充分体现了效率服务原则。一窗式管理工作的推进对税务机关内部提高税收征管效率，转变工作作风，实现依法行政起到了积极的推动作用，同时，对优化纳税服务，为纳税人营造更好的纳税申报环境和方式提供了保障，标志着依法开展纳税服务工作将向更深层的方向发展。
2、充分体现了税收优化原则。一窗式管理工作的实施实现了部分信息资源的共享，代表着税收征管信息一体化的进程，标志着现代税收征管工作发展的趋势。
3、充分体现了依法稽征原则。对纳税申报实施有效监控，防范纳税申报过程中可能出现的违法违规行为，为广大纳税人创造公开、公正的竞争环境。
为加强增值税管理，堵塞税收漏洞，优化纳税服务，从2003年7月份国家税务总局推行了增值税一般纳税人纳税申报一窗式管理。通过一窗式管理的推行，重整了业务流程、优化了管理程序、整合了系统资源、减少了纳税人的申报资料及数据核算工作，为纳税人营造了方便快捷的纳税环境，但在目前运行中还存在着一些亟待解决的问题。
（一）个别企业财务人员、办税人员的素质有待进一步提高
目前，在一些一般纳税人中，特别是中小私营企业，大多没有专职会计人员，有的一个会计人员担任几个企业的会计工作，且会计人员更换较为频繁，影响了申报质量。还有一些企业办税人员对《增值税申报表》表内的相关计算和各表间的逻辑关系掌握不熟，不能按规定要求填写申报资料，直到征期申报时发现问题才进行咨询。同时，由于企业申报时间过于集中（大多在每月的7、8、9号），造成企业在办税过程中相互影响的“堵车”现象，办税服务厅税务人员也无暇对纳税人辅导，一窗式服务应有的方便、快捷的特点难以显现。
（二）需要合理配置一窗式管理工作人员
由于一窗式是融税收业务与计算机技术于一体的一项全新的工作，只有有机结合才能顺利进行。然而在实际工作中，由于税务部门工作任务繁杂，且大多数县区又实行城乡人员交流制度，基层分局一窗式管理人员相对不稳定。加之一窗式管理处于刚刚推行阶段，各岗位工作人员对一窗式管理各个系统缺乏全面、细致的了解，对岗位之间业务结合的熟练程度差，时常造成出现问题不知如何解决的现象，也在一定程度影响了工作的正常运行。
（三）增值税一般纳税人纳税申报电子信息采集系统、专用发票企业端采集方式等相关配套软件应尽快推行
实行一窗式管理的目的有二个：一是实现票表事前比对，二是方便纳税人。从目前推行一窗式管理的情况来看，第一个目的已经达到，但实行一窗式管理后，原有的纳税电子申报系统由于不能适应新纳税申报和票表稽核的要求而停用，一般纳税人企业手工填制纸质进行申报，没有必要的逻辑关系审核，出错机率大。而税务端接受申报时还需向CTAIS系统中手工输入企业纳税申报表，既浪费了时间，又容易出错。目前的省级认证平台尚未搭建完毕，企业只能使用软盘介质或由税务人员进行手工认证，限制了网上认证的推行，同时制约了一窗式管理模式的作用。
（四）现行的一窗式管理的规定与具体情况相对滞后，缺少相应的管理办法与之配套
目前一窗式管理实际运行中，只有一窗式管理模式操作流程和几个文件规定，没有出台便于操作的《增值税纳税申报一窗式管理办法》。
（一）强化培训辅导，推行中介服务
一是加强对企业财务人员的培训和考核，实行增值税一般纳税人企业办税员持证上岗制度，切实提高企业办税人员素质，并鼓励有条件的纳税人自行网上申报和网上认证，从而有效提高纳税申报的质量。二是加强对税务内部人员的培训，使岗位人员熟练掌握各系统软件的操作，成为适应一窗式工作的复合性人才。三是切实发挥税务代理中介机构企业财务知识娴熟的优势，鼓励企业通过税务代理，代理纳税申报，提高申报质量，降低申报差错率。
（二）尽快完善网上申报软件与网上认证软件中间业务操作平台，加快推行进度
一是通过网上申报、网上认证和CTAIS系统紧密联系起来，实现企业端网上申报数据实时地下载到CTAIS系统中，经过自动比对后，未发现问题的，再向企业端发送“申报成功”的信息；对有问题的，当即向企业端发送“申报失败”及发生错误的详细信息，避免征纳双方的重复劳动，提高工作效率。二是充分利用各种信息资源，将金税工程几个子系统以及金税工程和征管之间紧密结合起来，使增值税的监控关口前移，有利于进一步防范和打击不报、少报销项税额或多报进项抵扣税额等偷骗税违法行为。三是加大网上申报和网上认证工作推行力度，强化相应的培训工作，不断扩大网上申报和网上认证的覆盖面，提高电子申报和网上认证发票的质量。
（三）强化办税流量控制，在申报期十日内合理分解各企业办税时间
根据各企业不同情况，灵活划分企业办税时间，“化集中为分散”，避免企业办税“高峰”期的出现，并努力提高服务质量。
（四）完善一窗式管理模式操作流程，制定《增值税一般纳税人纳税申报一窗式管理办法》
要实现真正意义上的“票税稽核”，就必须加快税收信息一体化的建设步伐，尽快规划和建立全国统一的纳税信息采集平台，将现行的金税工程软件和CTAIS软件进行整合，同时将其他税种的征管内容进行融合，从而实现一窗式管理的目标。有必要进一步完善一窗式管理模式操作流程，根据一窗式管理各有关系统和申报征收业务的业务特点，修订合理规范的操作流程；同时，尽快出台《增值税一般纳税人纳税申报一窗式管理办法》，详细制定一窗式管理的核心内容、操作规范、纳税人报送的资料，明确各种异常申报事项的分类以及处理方法，使申报工作做到有章可循、有据可查、有条不紊，使得纳税申报程序更为科学、合理，达到征管与服务双提速。