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绿色卫生检疫制度是指为保护人类与动植物的生命与健康、保护生态与环境而制定的所有有关法律、行政法规、规章、要求和程序，特别包括：最终产品标准；工序和生产方法；检验、检查、认证和批准程序；各种检疫处理，有关统计方法、抽样程序和风险评估方法的规定；与产品安全直接有关的包装和标签要求等。
世界各国，特别是发达国家，制定并实施了大量的绿色贸易壁垒措施。其表现形式大致包括绿色环境标志、绿色技术标准、绿色卫生检疫制度、绿色关税和绿色包装制度等。其中，绿色卫生检疫制度是指政府的有关部门为了确保人类及动植物免受污染物、毒素、微生物、添加剂等的影响，对产品进行严格检查，防止超标产品进入本国市场。
这种绿色卫生检疫制度一般是由各国政府机构颁布各种法令，制定严格的限量性标准，并授权检验机构依法检验管理，即法定检验。所谓法定检验是指一国商品检验检疫机构按照本国的法律法规，对指定的重要进出口商品或检验事项实施强制性的检验，非经检验合格，不准出口或者进口销售、使用。