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农垦企业是指农垦系统的所有企业。其中最大量、最有代表性的是国有农场。
(一)发展生态农业符合中国的国情。长期以来，中国的农业生产以非常薄弱的自然生态资源承担着数量巨大的人口生存所需食物的生产，只有大力发展生态农业，充分利用和节约农业自然资源，特别是通过保护耕地和水资源，避免耕地减少和水资源浪费，实现农业的可持续发展。
(二)发展生态农业可以改善农业的生态环境．为农业可持续发展提供条件。当前农垦企业与广大农村一样，在一定程度上存在着水土流失、土地沙漠化、土地盐碱化等问题，因此在今后的农业发展战略选择上，应大力发展生态农业，遏制农业生产退化和环境污染加重的趋势。在发展农业生产的同时，避免或减少对生态环境的破坏以及对自然资源的过度消耗。(三)发展生态农业可以进一步优化农业产业结构，提高农业的经济效益。发展生态农业可促进农业产业结构的调整，提高高效作物的比例，并使农、林、牧、副、渔各业能协调发展，不断提高农业生产系统的生产力，提高农业的经济效益，增加企业和职工的收入。
(四)发展生态农业可以提高生物能源的利用率，开发清洁能源，推动农业循环经济的发展。发展生态农业一方面可以提高农业内部资源的利用率，特别是废弃物资源的利用率，充分利用作物秸杆、树叶等发展畜牧业，利用牲畜粪便生产沼气，同时提供饲料和有机肥。另一方面发展生态农业可以进一步开发利用风能、太阳能、水能、地热等能源，解决农业能源短缺及环境污染问题。
(一)生态立体共生的生态农业发展模式。该模式能使处于不同生态位的生物类群在系统中各得其所，相得益彰，更加充分地利用太阳能、水分和矿物质营养元素，并建立一个空间上多层次、时间上多序列的产业结构，从而获得较高的经济效益和生态效益。此类生态农业可划分为立体种植、立体养殖、立体种养结合的类型。
(二)物质循环利用生态农业发展模式。这是按照生态系统内能量流动和物质循环规律而设计的一种良性循环的生态农业系统。在该系统中，一个生产环节的产出(废弃物产出)是另一个生产环节的投入。使得系统中的各种废弃物在生产过程中得到再次、多次的循环利用，从而获得更高的资源利用率，可分为种植业内部、种养业结合、种养加结合、种养沼气三结合、种养加沼气四结合等物质循环利用类型。
(三)生物相克避害的生态农业发展模式。这种模式是利用生物相克关系，人为地对生物种群进行调节。在生态系统中增殖有害生物的天敌种群，以降低害虫、害鸟、杂草、病菌的危害，从而减少农作物的经济损失，具体分为以虫克虫、以鸟克虫、以草克草、以草克虫、以菌克虫等类型。
(四)主要因子调控的生态农业发展模式。这种模式主要是针对当地主要环境问题，采取人为措施对其主要形成因素加以调控、治理的生态农业发展模式。在一些地区由于森林的过度采伐和草原的过度开垦使得土地沙漠化、水土流失等成为该地区影响农业生产和生态平衡的主要因素，可以通过植树造林、控制沙漠化、治理水土流失等措施改变生态环境。此外还有贸工农结合的生态农业发展模式、以庭园经济为主的院落农业生态发展模式等。