2010年4月6日，吴彦祖与相恋8年的混血名模Lisa.S在南非举行婚礼。2013年5月30日，吴彦祖的妻子产下一女，取名吴斐然，一家人生活得幸福快乐！先前传出吴彦祖加盟HBO科幻影集《西方极乐园》消息，近日和爱妻牵着女儿走红毯，瞬间成为镁光灯焦点。 为了支持父亲，9岁的女儿特意染了红头发，粉色上衣搭配黑色半身裙，脚踩马丁靴，活泼时尚遗传父母的好基因。
吴彦祖被问及“是否打算让女儿进演艺圈”时，吴彦祖深思后表示，演艺圈对女性特别苛刻，从外貌到穿着，什么都可能被批评，不是健康的职业，“我希望她（女儿）会，若她真的想，我也不会阻止，但不会主动鼓励。”吴彦祖还坦言希望女儿最好是能当医生或律师，因为他爸妈以前希望他从事那方面，不过，他认为女儿很有创意，将来有机会成为艺术家或设计师。