1.合同公证与鉴证的性质不同。合同鉴证是工商行政管理机关依据《合同鉴证办法》行使的行政管理行为。而合同公证则是司法行政管理机关领导下的公证机关依据《公证暂行条例》行使公证权所作出的司法行政行为。
2.合同公证与鉴证的效力不同。经过公证的合同，其法律效力高于经过鉴证的合同。按照《民事诉讼法》的规定，经过法定程序公证证明的法律行为、法律事实和文书，人民法院应当作为认定事实的根据。但有相反证据足以推翻公证证明的除外。对于追偿债款、物品的债权文书，经过公证后，文书还有强制执行的效力。而经过鉴证的合同则没有这样的效力，在诉讼中仍需要对合同进行质证，人民法院应当辨别真伪，审查确定其效力。
3.合同公证与鉴证的适应范围不同。公证作为司法行政行为，按照国际惯例，在我国域内和域外都有法律效力。而鉴证作为行政管理行为，其效力只能限于我国国内。
《公证暂行条例》第四条 公证处的业务如下：
（一）证明合同（契约）、委托、遗嘱；
（二）证明继承权；
（三）证明财产赠与、分割；
（四）证明收养关系；
（五）证明亲属关系；
（六）证明身份、学历、经历；
（七）证明出生、婚姻状况、生存、死亡；
（八）证明文件上的签名、印鉴属实；
（九）证明文件的副本、节本、译本、影印本与原本相符；
（十）对于追偿债款、物品的文书，认为无疑义的，在该文书上证明有强制执行的效力；
（十一）保全证据；
（十二）保管遗嘱或其它文件；
（十三）代当事人起草申请公证的文书；
（十四）根据当事人的申请和国际惯例办理其它公证事务。