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财政审计调查是按照一定的目的和要求，并结合财政审计工作，广泛搜集材料的过程。
财政审计调查区别于一般常规调查，具有以下特点：
1.目标上的宏观性。财政审计调查的出发点，是从加强宏观调控着眼的，调查的项目要雷绕国民经济、财政管理，财税改革、财税政策制度等方面存在的问题来确定。
2.对象上的广泛性。财政审计调查可选择不同财政管理体制的地区；或在同类财政管理体制的地区选择财政收支数额太，财政管理状况差异太的地区；或选择财政收支管理的薄弱环节作为调查对象。同时，被调查的单位要有一定的数量.具有一定的覆盖面，从而便于在各种复杂的情况下.找出共性和倾向性的问题。
3.工作上的规范性。财政审计调查虽然不采用审计的全部工作程序，但仍然是按照审计的基奉规范进行工作，如查帐、取迁，评价、报告等。
4.应用上的反馈性。财跛审计调查的目的是，根据宏观经济管理和改革的需要，为领导机关进行宏观决策提供辱息和依据，为此，它所揭示的一般是是审中涉及不到的较深层次的问题.如根源，危害、趋势等等。这些情况提供给政府和有关部门可作为决策活动的佐证、依据、参考；
财政审计调查项目选择要符合下列要求：
1.要抓住宏观经济管理方面的重点问题和要害问韪进行调查。如国有资产流失等问韪。
2.要抓住财税体制改革过程中暴露出的深层的问题和难点问题进行调查。
3.要抓住干部群众关心的热点如工资不能及时拨付、农业资金不到位等问题进行调查。
4.要抓住社会上反映强烈的普遍性问题调查，科技、教育的投入问题进行调查。
5.要抓住政府和领导关心的财政收支平衡、赤字、潜亏和再生产投入问题，即生产、消费、积累的问题进行调查。
财政审计调查的方式主要有三种：
1.同步审计调查：配合财政审计同步专题调查。
2.联合审计调查：统一部署，上下级审计机关或与有关部门联合，就某个专题进行审计调查。
3.后续审计调查：就某个地区审计中发现的，但因种种情况尚未查透的问题.在审计工作结束后专门开展审计调查。
财政审计调查的基本工作程序可分为准备、实施、报告、反馈四个阶段，具体是：
(1)确定调查项目；
(2)编制调查方案；
(3)发出官计调查通知；
(4)就地实施审计调查书；
(5)调查组提出审计调查报告；
(6)向被调查单位核实调查情况；
(7)汇总审计漏查报告进行归纳分析，以书面形式向上级审计机蓑和有关部门反馈意见和建议；
(8)审计调查资料旧档。