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税收征管信息系统是税务信息系统最主要的系统，主要完成税务登记、税源控管、纳税申报与监控等功能。
作为税务部门的核心系统，支持多种方式进行纳税申报。系统通过与内部管理系统和外部的信息交换，可以很好地为税收决策提供支持。税收征管信息系统提供了包括管理服务、征收监控、税务稽查、税收法制和系统维护五个系列的功能，如图所示。
1．管理服务
管理服务主要包括税务登记管理、认定管理、税收证明、文书管理、发票管理和证件管理等子系统。
(1)税务登记管理
税务登记管理主要包括开业登记、变更登记、注销登记、验换证管理、重新税务登记管理、非正常户管理。
(2)认定管理
认定管理主要包括增值税一般纳税人的认定管理、出口企业退税登记认定管理、委托代征管理、代扣代缴义务人管理、其他税务认定管理。
(3)税收证明
税收证明主要包括金银首饰证明管理、居民证明、纳税证明、报验登记。
(4)文书管理
文书管理主要包括文书通用流程、减免退类文书、所得税类文书、核定类文书、汇总申报文书、延期类文书、其他类文书。
(5)发票管理
发票管理主要包括内部管理(发票调拨管理、柜台库存管理、发票盘存结存管理、发票印制管理)和外部管理(发票发售管理、发票缴销管理、发票使用管理、发票领购簿管理、发票鉴定管理、防伪税控资格管理)。
(6)证件管理
证件管理主要包括税务登记证件打印销号、证件状态管理、税务登记证件重新发放、纳税人可持有证件数量限制设置。
2．征收监控
(1)申报征收
申报征收主要包括纳税申报、税款征收、催报催缴、纳税保证金查询。
(2)税收会计
税收会计主要包括会计记账、期末结账、年终结转、账务回退、账务批处理、记账凭证手工录入、金库对账、调库(更正)通知书、调库(更正)通知书销号、免抵退税审批通知单、调库销号、科目余额查询、账簿查询、记账凭证查询、记账凭证所附原始单据查询、科目汇总表查询、调库(更正)通知书查询、税收“免抵调”查询、欠税清册查询、关停空壳企业欠税审批查询、账外呆账清册查询、呆账类型调整文书查询、在途税金统计＼会计口径查询、重点税源清册、重点税源统计、呆账手工录入、核销呆账、呆账调账凭证、入库销号和退税处理。
3．税务稽查
税务稽查主要包括案源管理、稽查实施、稽查审理、稽查执行和稽查其他处理等子系统。
(1)案源管理
案源管理包括案源登记、复查选案、案源处理。
(2)稽查实施
稽查实施包括实施任务接收、立案处理、通知(证明)处理、稽查收据清单、笔录处理、稽查事项报告、稽查实施总结性文书、提请审理处理、处罚告知处理、决定性文书处理和其他处理。
(3)稽查审理
稽查审理包括审理登记、笔录处理、审理(查)报告处理、处罚告知处理、听证处理、决定性文书处理和其他处理。
(4)稽查执行
稽查执行的功能有执行登记和稽查执行文书处理。
(5)稽查其他处理
稽查其他处理包括提取挂案申请表、文书批量审批、稽查案件实施人员调整、稽查案件审理人员调整、稽查案件执行人员调整。
4．税收法制
税收法制主要包括违法违章处理、内部协查、一般执行、保全强制、查询统计等子系统。
(1)违法违章处理
违法违章处理包括违法违章案件产生、责令限改处理、行政处罚决定(简易)、不予行政处罚决定(简易)、违章一般处罚、运行数据维护。
(2)内部协查
内部协查的功能有内部协查管理、问题纳税人监控日志、提请内部协查文书处理。
(3)查询统计
查询统计功能有违法违章综合查询、违法违章和一般执行其他查询统计。
5．系统维护
系统维护主要包括系统初始化、参数设置、数据字典、权限管理、工作流管理和通用报表等子系统。
实施和使用税收征管信息系统可以起到以下几个方面的作用：
1．加强对税务行政执法的监督
加强对税务行政执法的监督，避免了税收执法的随意性，为纳税人提供了公开、公平、公正的纳税环境。
2．强化对税源的全方位监控
强化对税源的全方位监控，初步形成了全国性的税源监控网络。
3．加强税收数据的综合分析和利用
加强税收数据的综合分析和利用，为国家各级领导的相关决策提供了可靠依据，提高了决策依据的准确性。
4．税务机关转为主动服务
税务机关从被动服务转为主动服务，纳税人可以不受时间、地点的限制，得到7*24小时的全电子化双向涉税服务。
5．税务机关成本降低，效率提高
税务机关成本降低，效率提高，实现了从粗放式管理到集约化管理的全面转变。