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创新生态链源于创新生态理论，是指创新主体之间环环相连、存亡相依，形成了不可截断的食物链，必须保持整个生态的多样性和平衡性，才能实现创新生态的健康、协调、可持续发展。
例如：车企在生产汽车时，不可能将所有零部件都自己生产，而是应该利用全球的生产资源，与国际合作，并且在合作的同时抓住核心技术，有所创新。
优化创新生态链既是对创新资源要素的最有效聚集和最充分利用，也是对创新主体之间形成适度的互联竞合效应并产生合理的外溢与扩散，通过优胜劣汰机制，实现创新生态旺盛的生命力和创新力。
创新生态链的提出，也是对硅谷的繁荣与日本1990年代“十年衰落”的反思。1990年代以来，日本经济的低迷乃至出现“失落的十年”，而美国重振制造业雄风、硅谷更是成为持续增长的代表。
2004年，美国布什政府提出了维护国家创新生态体系的政策报告。
2006年，欧盟也提出优化创新生态链，打造创新型欧洲的政策性文件。
2012年1月，深圳市政府工作报告中，提出“构建充满活力的创新生态链体系”
2012年年7月，深圳向全国科技创新大会提呈了“营造创新生态加快建设国家创新型城市”的典型发言。2013年的全国人大分组审议中，深圳代表提出更加注重构建“综合创新生态链体系”。
创新生态链（系统）三个要点：
在创新生态链中，整合创新资源十分重要。IBM在PC机的创造上抄了苹果公司后路；苹果公司整合资源创造出高技术产品；华为公司只做自己优势的产品而其他的会和先进国家合作;潍柴动力公司注重引进人才引进技术的做法；海尔公司把全球创新结果聚集起来；德国M Braun公司整合技术设备。
中国应进入全球创新生态链，但是中国目前缺少整合创新资源的企业。所以中国需要大批青年人去创新，同时企业也应学会整合创新资源。
中国创新生态链发展发展存在许多问题。新兴技术产业缺乏企业人材，科技工作管理存在问题，市场化专业化的科技创新服务体系没有被重视，自主创新局限性和误导，教育和创新文化导向错误。
同时政府在支持产业项目时也存在很多问题：只注重技术，缺乏研究团队，商业模式等非技术因素的支持；急于求成，拔苗助长，看量不看质，没有很好的衡量制度；过多干预，不能依靠市场发现选拔机制等。