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建设用地使用权消灭的情况主要包括：
一、建设用地使用权期间届满；
二、建设用地使用权提前收回；
三、因自然灾害等原因造成建设用地使用权灭失等情形。
建设用地使用权消灭后，出让人应当及时办理注销登记。
根据国土资源部颁布的土地登记规则第54条、第55条、第56条的规定，县级以上人民政府依法收回国有土地使用权的，土地管理部门在收回土地使用权的同时，办理国有土地使用权注销登记，注销土地证书。
国有土地使用权出让或者租赁期满，未申请续期或者续期申请未获批准的，原土地使用者应当在期满之日前十五日内，持原土地证书申请国有土地使用权注销登记。
因自然灾害等造成土地权利灭失的，原土地使用者或者土地所有者应当持原土地证书及有关证明材料，申请土地使用权或者土地所有权注销登记。
考虑到出让人全面掌握建设用地使用权消灭的情形，所以，本条规定注销登记由出让人及时办理。建设用地使用权注销后，登记机构应当收回建设用地使用权证书。
