这是个比较宽泛的问题，异性朋友回复你谢谢是什么意思，这要看你对异性朋友到底都做了什么，不是无缘无故的随便地回复你说声谢谢，而是有其内在含义或意义的，其谢谢的含义或意义要视不同情况而定。
一般来说，异性朋友回复你谢谢，一定是你对她做了什么事或者说了什么话，你做的事大都是对她有利的事，你说的话大都是对她有利的话，你做的事或者说的话对她来说大都是正面的东西，她是对你的好意或肯定的回应，说明她记着你了，或者她想着你了，或者她在意你了，或者说她心里还是有你的。
比如说，你为她做了什么了，你为她付出什么了，你或是关心她了，或是帮助她了，或是理解她了，或是信任她了，或是尊重她了，或去看重她了，或是在乎她了，或是珍惜她了，凡此种种，她都可能回复你说声谢谢。
再比如说，你的朋友得到某项荣誉或物质奖励或者精神奖励等的时候，你或是称赞她了，或是夸赞她了，或是鼓励她了，或是激励她了，凡此种种，她都可能回复你说声谢谢。
总之，异性朋友回复你谢谢是有其内在含义和意义的，大都是你做了对她有利的事或者说了对她有利的话而对你的正面回应，是异性朋友对彼此之间为人处事的好意或美意的正常回应。
