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百篇单细胞测序领域文章集

截至2022年10月,助力发表超过百篇单细胞文章,平均影响因子12+,总影响因子1200+,发表文章中致谢公司77次,作者署名5篇(含共同一作),可谓硕果累累。

博观而约取,厚积而薄发。四年间,累计完成1500+个服务项目、15000+例样本的单细胞解离与测序。样本类型涵盖人、大/小鼠、羊、兔、猴、鱼、鸡、蟹、蜘蛛等400余种不同的动物组织类型以及拟南芥、水稻、玉米、棉花、大豆、小麦、番茄、茶树、桑树、杨树及药用植物等50余种植物样本。将单细胞技术在农林牧渔等诸多领域的广泛应用不断推向深入。

《百篇单细胞客户文章集》,汇总了助力发表的超百篇单细胞文章,内容翔实,包括期刊、影响因子以及部分文献解读。每篇文章都凝聚着客户和欧易人的努力与心血,都见证着与客户互动、共同探索生命未知的愉悦历程,都记录着单细胞事业部不断发展壮大的重要时刻,照耀着欧易人不断奋进前行和美好的前程。

同时这本“秘籍”能方便读者快速查阅相关文章,也将帮助读者更深入的了解欧易的单细胞组学服务,更好掌握单细胞文章不同类型的写作方法,是在单细胞论文撰写途中的“通关宝典”,灵感枯竭时翻看没准可以得到意外的惊喜哦~

百篇单细胞文章是个了不起的成就,但也仅仅是起点,随着研究的深入,更多的生物学问题需要我们和客户一同探索,我们也愿意和客户一起相互并肩,成就彼此,用优质的服务将成果快速转化。

期待下一个百篇甚至千篇文章的快速到来!

Global Dynamic Molecular Profiling of  Stomatal  Lineage  Cell  Development  by  Single-Cell  RNA  Sequencing

【发表时间】:2020.10.6

【发表期刊】:Mol Plant

【影响因子】:21.949

【合作单位】:河南大学

【主要研究内容】:本研究首次对拟南芥气孔谱系细胞发育过程进行了单细胞转录组测序分析,鉴定了气孔发育过程中各细胞类群显著表达的 marker gene,并分析了其所参与的 GO 功能。为了分析气孔细胞早期发育阶段的基因表达调控机制,构建了气孔分生母细胞中基因表达的转录因子调控网络。进一步通过分析所鉴定的标记基因和转录因子的拟南芥突变体的气孔发育表型,确定了这些基因在调控气孔发育中所扮演的重要角色。本研究,为利用单细胞RNA-测序技术在鉴定新的标记基因,以及解析气孔谱系细胞发育的调控机制提供了新的研究思路和技术体系。

Topological analysis of hepatocellular carcinoma tumour microenvironment based on imaging mass cytometry reveals cellular neighbourhood regulated reversely by macrophages with different ontogeny

【发表时间】:2021.7.12

【发表期刊】:Gut

【影响因子】:31.793

【合作单位】:浙江大学医学院第一附属医院

【主要研究内容】:通过成像质谱流式细胞仪检测 HCC,建造了第一个且最大的单细胞病理学景观库;确定了三种主要类型的肿瘤内区域,具有不同的肿瘤、基质和免疫细胞分布模式;揭示了许多与患者临床结果相关的区域细胞功能单元;Kupffer细胞和浸润巨噬细胞反向调节区域免疫;发现了Kupffer细胞的消耗大大增加了浸润性巨噬细胞的数量,减少了肝脏肿瘤的生长;Kupffer细胞特异性靶向可作为一种新型免疫治疗药物肝癌治疗的方法。

Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γ δ T cells

【发表时间】:2021.11.16

【发表期刊】:Science Bulletin

【影响因子】:20.577

【合作单位】:暨南大学/珠海人民医院

【主要研究内容】:本文作者对小鼠胸腺、脾脏和淋巴结中的γ δ T细胞开展了单细胞转录和染色质开放性组学分析,系统性解析了其异质性。作者发现经典的γ δ T1(IFN-γ+)和T17(IL-17A+)亚群内部也存在显著的异质性并推断了其潜在调控机制。通过对胸腺γ δ T细胞进行拟时序分析,作者构建了其发育轨迹。有意思的是,作者发现胸腺中存在一群独立于T1和T17的新亚群GZMA+ γ δ T细胞,并且发现该亚群具有前体细胞特征。作者还通过SCENIC分析、转录因子识别基序富集发现了一个新的γ δ T17转录抑制因子NR1D1,并利用基因敲除小鼠进行了验证。综上,本文构建了小鼠γ δ T单细胞转录图谱和单细胞染色质开放性图谱,为深入解析γ δ T细胞异质性和亚群调控机制提供了宝贵的资源库。

A mechanosensitive lipolytic factor in the bone marrow promotes osteogenesis and lymphopoiesis

【发表时间】:2022.6.15

【发表期刊】:Cell Metabolism

【影响因子】:31.373

【合作单位】:中南大学湘雅医院

【主要研究内容】:本文作者通过对关于运动促进骨形成和免疫的原创性研究成果,揭示骨髓巨噬细胞在运动后分泌丰富的reticulocalbin-2(RCN2),RCN2作为一种脂解因子结合脂肪细胞受体复合物Neuropilin-2/Intergrin-b1启动骨髓脂肪脂解,为淋巴生成和骨形成提供能量,并且RCN2重组蛋白能显著改善小鼠骨丢失和淋巴细胞生成下降的表型。

Single-cell atlas of keratoconus corneas revealed aberrant transcriptional signatures and implicated mechanical stretch as a trigger for keratoconus pathogenesis

【发表时间】:2022.7.12

【发表期刊】:Cell Discovery

【影响因子】:38.079

【合作单位】:山东第一医科大学

【主要研究内容】:作者系统地研究了圆锥角膜和健康角膜样本之间的细胞类型特异性转录组,证实了角膜基质细胞在该疾病中的关键作用。研究证明了角膜基质细胞的细胞外基质降解在该疾病中的重要作用,揭示了“机械力—力学信号—蛋白酶”作用轴在促进圆锥角膜进展中的重要作用,为“揉眼可加剧圆锥角膜”的临床现象提供了解释。此外,角膜上皮病变、免疫细胞中炎症信号的增强以及细胞间通讯失调也参与了圆锥角膜的形成。以上发现为圆锥角膜基础研究、深入理解圆锥角膜等扩张性疾病的发病机制提供了重要的数据资源和理论参考,更为该疾病的预防和诊疗提供了理论依据。

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