祷告当有信心，这是圣经的指示；祷告当合乎神的旨意，也是使徒的教训。但最蒙悦纳的祷告是被圣灵感动所发出的祷告，在圣灵里的祷告，被圣灵感动的祷告，自然就是有信心的祷告，自然就合乎神的旨意。神晓得圣灵的意思，因为圣灵照著神的旨意替我们祈求。
祷告是三位一体的神在我们身上同时相聚，要通过我们成全祂的旨意。心被圣灵感动，奉圣子的名向圣父祷告，这样的祷告一定要蒙应允。所以约书亚敢在以色列众军兵的面前大声吩咐：「当耶和华将亚摩利人交付以色列人的日子，约书亚就祷告耶和华，在以色列人眼前说：日头啊，你要停在基遍；月亮啊，你要止在亚雅崙谷。于是日头停留，月亮止住，直等国民向敌人报仇。这事岂不是写在雅煞珥书上吗？日头在天当中停住，不急速下落，约有一日之久。」（书十12至13）
以利亚在众百姓和巴力的先知面前，祷告从天上降火，又祷告从天上落雨，神立刻就降下火，又立刻降了雨。
他们为什麽有这样十足的信心和勇敢的祷告呢？就是因为他们的祷告是被圣灵充满，神在他们里面作自己的工。我们也有时有这样的经历，心中有感动为一件事或一个人祷告，神就应允垂听我们的祷告。在约书利亚和以利亚心中作工的神，也在我们心中作工；我们也经历神的信实，看见神的荣耀，在我们心中经验的神，比神为我们所成全的事更显宝贵。就好像朋友送我们礼物，朋友的友谊是比礼物更为宝贵。
「况且我们的软弱有圣灵帮助，我们本不晓得当怎样祷告，只是圣灵亲自用说不出来的歎息替我们祷告。鉴察人心的，晓得圣灵的意思，因为圣灵照著神的旨意替圣徒祈求。」（罗八26至27）
