唐代孔颖达在注释古文献中，涉及形神、魂魄的问题。其在《左传-昭公七年疏》中说：“人之生也，始变化为形，形之灵者，名之曰魄也。既生魄矣，魄内自有阳气，气之神者，名之曰魂也。魂魄神灵之名，本从形气而有。形气既殊，魂魄亦异，附形之灵为魄，附气之神为魂也。” 宋元明清时期，形神问题的性质已与范镇之前的情况有异了；不再是神灭神不灭之问题，而是本质、本体与作用、功能之论。 周敦颐在其《太极图说》中认为：“唯人也得其秀而最灵。形既生矣，神发之矣，五性感动而善恶分。” 朱熹在其《朱子语类》卷九十四中解释周敦颐这句话时做了如下发挥：“‘形既生矣’，形体阴之为也；‘神发之矣’，神之阳之为也。盖阴主翕，凡敛聚成就者，阴为之也；阳主辟，凡发畅挥散者，阳为之也。” 王廷相在《答何柏斋造化论》中批评何瑭“神为阳，形为阴”之形神二元论；实际上也是对朱熹“形体阴之为也，神之阳之为也”的批判。对此他说：“神者，形气之妙用，性之不得已者也，三者一贯之道也。今执事以神为阳，以形为阴，此出自释氏仙佛之论，误矣。”
熊伯龙是一个无神论者，他以“辟神怪祸福之说为主”，而定书名为《无何集》。
王夫之把形神问题与认识论相联系，他在其《张之正蒙注-太和篇》中说：“形也、神也、物也，三相遇而知觉乃发。”即认为，形是指人的形体感觉器官，具有“视听之明，可以摄物，心知之量，可以受物。”（《张之正蒙注-大心篇》）的功能。并认为：神是指精神现象或思维活动。如其在《思问录-外篇》中说：“君子独言心者，魂为神使，意因神发，魄待神动，志受神摄，故神为四者之津会也。”
