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质谱流式细胞技术:高通量单细胞蛋白质组技术

时间:2022-08-03 09:36:30 热闻 我要投稿

细胞是生物体最基本的结构和功能单位,蛋白质是生命活动的功能直接执行者,不同的细胞决定了组织器官的特异性功能。随着单细胞分析技术发展,多维单细胞组学数据在分析细胞种类和功能层面带给我们更广阔更深入的视角,单个细胞的蛋白质动态变化及细胞功能亚群深入研究,可以帮助我们更好地揭示单细胞层面的精细变化,解析复杂的生物学问题。

质谱流式细胞技术(Mass Cytometry,CyTOF)结合了传统流式技术高效的单细胞研究能力和飞行时间质谱的全谱高分辨率优势,采用金属标记抗体与待测抗原结合,实现了单细胞水平的高通量分析,并且能够同时获得单个细胞的多种参数,识别不同靶向蛋白。质谱流式与单细胞转录组测序相比,质谱流式技术能够直接获得蛋白水平的信息,捕获检测的细胞也更多信息更丰富。

质谱流式单细胞蛋白质组技术,在推出基于布鲁克tims TOF Pro2 4D蛋白质组质谱平台的单细胞蛋白质组后,再度推出基于质谱流式平台的新一代高通量单细胞蛋白质组技术。

Starion星瀚质谱流式系统,具有高通量高分辨率超高速的特点,可实现在单细胞分辨率下同时对数十种目标蛋白的深度分析。进一步丰富鹿明生物单细胞多组学技术服务产品线,为科研工作者提供全面深入的科研技术服务。

技术流程

质谱流式技术采用金属标记的抗体识别细胞表面或胞内的抗原,标记后的细胞经雾化后被分离成单个细胞进入电感耦合等离子体矩管中进行离子化,离子云随后被传输至飞行时间质量分析器中,检测器依次记录各种金属离子到达的时间,检测出每个细胞中各种标签金属的含量,最终形成不同的金属离子信号峰。检测产生单个细胞质谱数据,再通过分类、聚类和降维算法进行处理,反映基于靶蛋白丰度的各种细胞群体的表型和功能。

质谱流式作为一项新兴的高通量单细胞分析技术,已广泛应用于肿瘤、免疫、生物标志物、疾病分型、细胞治疗、疫苗、药物研发等生物学及医学研究的诸多领域。自首篇文献报道以来,相关文献呈现逐年快速上升趋势,其中近40%发表于CNS等顶级学术期刊及其子刊上,近五年发表文献IF影响因子均值为13.84。

产品优势

超高通量:能捕获超过百万个细胞的单细胞蛋白质数据;

真单细胞:能获得单个细胞水平的蛋白质定量,同步实现对单细胞表型、信号通路及功能的数据整合分析

精细分型:同时检测数十个蛋白Marker,实现更加精细的细胞分型及细胞亚群的功能研究;

快速检测:30min运行时间内检测50万个细胞;

准确性:四极杆设计精准筛选标记的金属离子,无背景信号干扰;

高分辨率:全新设计的飞行时间质量分析器分辨率≥700。

应用领域

研究思路

目前已经有大量的单细胞转录组+质谱流式相结合的高分文章发表,给我们提供了非常值得借鉴的研究思路,既可以同时进行联合分析,也可以基于其中一种研究结果采用另外一种技术进行后续的验证或者深入分析。例如,一方面可以对前期单细胞转录组的研究结果,采用质谱流式在单细胞蛋白质层面进行验证,也可以对单细胞转录组筛选到的关键细胞亚群通过质谱流式进行蛋白层面更精细的细胞分群分析,分析稀有的细胞亚群。另一方面也可以基于质谱流式的细胞分群信息,对筛选到的关键细胞亚群进行单细胞转录组的研究。最后还可以采用基于单细胞蛋白质组技术对锁定的关键细胞亚群进行深度的蛋白质组研究,在蛋白层面进一步进行机制机理等研究。

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本文系鹿明生物原创

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