对大部分变性者而言，这不是他们的突发奇想或者一种生活方式的选择，而是他们无法适应自己原本的生物学性别。对他/她们来说，变性是他们迫切想达到的目的，是快乐的目的，认同/成为另一种性别，是向往，是渴望。
精神科医生一开始使用“易性癖”一词来定义他/她们，认为是一种“性心理障碍”。后来又以“性别认同障碍”来界定，认识到这一行为背后存在着性别认同的问题。可是，变性，或者无法认同自己的性别，为什么说就是一种障碍？现在，就改用“性别烦躁（gender dysphoria）”来指称这一部分人群：他们对自己的生物学性别感到不适，并持久地坚信自己应该属于另一种性别，或者强烈地想成为另一种性别。医学上关注的重点不再是性心理的异常，也不再是性别认同的异常，而是主观的不适和痛苦。
至于为什么会有这种心理和生理性别上的冲突，科学研究还无法很好地回答。简单地说，人类的默认性别设置是女性，如果存在Y染色体，那么性别决定基因会促成雄性激素的分泌和男性器官的发育，最终成为男性的胚胎，反之，则成为女性。但是，生命的过程总是充满着无奈的意外，一些胚胎发育时期的激素暴露异常，会产生性别发育的障碍。性别发育障碍的人群极有可能发展为自我性别认同的紊乱，也就是说他们/她们会感到心理上的性别和生理上的性别不匹配。但事实上，大部分想要改变性别的人，并不存在这样的发育障碍。目前的研究只是推测可能同样和胚胎时期的激素暴露情况有关，具体原因仍需要科学探索。当然“为什么”更多的是个科学范畴的命题，从现实的层面而言，回答“为什么”可能并不是太重要，而更多地是去理解和支持他们。