提到方正科技，便不能忽略它的实际控制人方正集团，也是北大“方正系”的扛把子。
公开资料显示，方正集团是北京大学旗下校企，股权穿透后的最终控制人为教育部。背靠方正集团这棵大树，是方正科技资本故事中最为重要的注脚。
而在方正集团资产规模日益扩大，并逐渐发展成为中国第一大校企的过程中，魏新、李友两人又是不得不提起的过往。
曾是北大教授的魏新，1999年加入方正集团，并于2001年担任方正集团董事长。同年，此前具有10余年审计专业背景的李友，被魏新招揽加入方正。
2001年，魏新提出“方正集团在专业化的基础上，走多元化战略发展”。而资本扩张则成为了魏新、李友执掌下的方正集团实现多元化的重要手段。
2002年后，方正集团逐渐开始用“产业+资本”两条腿走路，在资本市场上动作频频，相继收购了浙江证券、江苏苏钢等资产，将主营业务由单一的IT，扩展到医疗医药、房地产、金融等领域，打造成了一家多元化的投资控股集团。
公开资料显示，2003年初，方正集团净资产为1.5亿元，总资产100亿元；而到2014年，方正集团的净资产达483亿元，总资产已膨胀至1521亿元，旗下拥有方正科技（600601.SH）、方正证券（601901.SH）、中国高科（600730.SH）、方正控股（0418.HK）等多家上市公司。
彼时，李友曾表示：“（方正集团）IT、医疗医药、地产、金融整合完成，板块的发展将能支撑方正未来10-20年发展的产业基础。”
第三方观察人士向野马财经（微信公号：ymcj8686）分析道，“方正宽带、方正国际置入方正科技，正是基于上述背景发生的。彼时，版图已横跨多个领域的方正集团，曾试图将内部不同产业资源协同整合，依托方正集团这艘‘大船’拉动旗下各公司的‘小船’”。
“方正整个IT产业是有完整商业逻辑和模型在里面的。按照当初的设想，方正希望将方正宽带做成平台，开放给集团内部如地产、医疗等产业做接入。如果计划得以实现，完成3年业绩对赌应该是没问题的。但后来方正集团出事后，整个战略就打乱了，没有依照原先的部署执行。”接近方正科技内部的人士曾向野马财经（微信公号：ymcj8686）表示。
天有不测风云，人算终究不如天算。
上述人士所称的“方正集团出事”，曾经在资本市场闹得沸沸扬扬。2014年12月，也就是方正科技完成方正宽带、方正国际的收购后不久，方正集团因民族证券控股权争夺问题，与昔日“亲密盟友”政泉控股发生恶斗，双方屡次相互举报，互曝丑闻。
2015年1月，方正集团原董事长魏新、原董事兼CEO李友被带走协助调查。方正集团这艘大船，似乎随之走进漩涡之中，原先设定的“航向”也悄然地发生改变。