南京是江苏省的省会，拥有2600多年的城市，这里历来是一个充满了文化气息的城市，历代十大王朝都在这里建立了自己的首都。南京境文底蕴深厚，名胜古迹多，佛教文明享誉世界，并有许多具有悠久历史的寺庙，例如，比丘禅院。
提到南京的古刹，人们首先会想起中国四大古刹之首的栖霞寺和“南朝古寺”——“南朝古刹”——“南朝古寺”——也是外来旅游者来南京的必经之处。而在当地居民，特别是南京人心目中，位于汉府街4的“维罗寺”，比其他两个寺庙都要尊贵。
相传，明嘉靖元年（1522—1566年），由于寺院内有毗卢遮那佛像，故称“比丘”。在梵文中，“毗卢遮那”是佛教中的至高无上的神，翻译为“大日如来”。有学者在整理《南京宗教史》时，曾注意到，这座寺院是南朝时期的“四百八十座寺院”，有1500多年的历史。
清代乾隆，仿照他的爷爷康熙六次下江南，在他从江南来到南京的头一夜，就住在了他的毗卢寺。当天晚上，乾隆去看望了百余年的方丈法空长老，与他通宵论道。这位长老是清朝皇帝的贴身侍从，是江南有名的僧人。
乾隆在毗卢寺逗留三日，这三日他微装造访夫子庙，并下令捉拿“一枝花”，这才离开寺庙，迎接群臣，开始六次江南。毗卢庵在其后一百多年里，佛教仍然兴旺，但在太平天国时代，南京栖霞山却是太平军与清兵的主力战场，寺庙也在战争中被摧毁。
清光绪时期，曾国藩的弟弟、晚清名将曾国荃在南岳衡山的时候，对海峰大师说：“若我能在两河上建一座寺庙，就可以了。”曾国荃果然被提拔为两江总督。清朝光绪十年1884年，曾国荃在毗卢庵原有的地方，将“庵”改为“寺”，并聘请海峰大师为毗卢寺的首位住持。
经改建的毗卢庙，东至故宫，西至总统府，北至珠江路，南至长江路，是南京历史上最大的寺庙之一。万佛楼是中国现存最大的汉代佛教仿宋时期的仿宋单体建筑，上面珍藏着清刻版本的《乾隆大藏经》168册，全球只有40件，被誉为国家瑰宝。
1932年，中国佛教学会总部由上海移往南京毗卢寺，其间，中华佛学会及中国中医医院亦于毗卢寺设立。从此，毗卢寺被认为是中国佛教、中国中医的重要场所，是中国佛教由正统到近代的标志，也是南京“佛都”地位的重要组成部分。毗卢寺，也是南京人心目中的佛门，每年都有无数的信徒慕名而来，为自己的仕途而祈祷。另外，很多南京的人在腊八节那天都会来这里吃上一大锅的腊八粥，这已经成了一种风俗。
如今的大佛，虽然比以前大了很多，但内部的情况，已经完全不同了。百余年之前，曾国荃亲自栽种的两株银杏已经结出了丰盛的果实；大雄宝殿里，从南岳衡山送来的香木仍是香气四溢，而“观自在”高8.8米的佛像巍峨庄严，随着钟声、暮鼓声、悠扬的佛号，毗卢寺将传承数千年的辉煌，在历代游客的祈祷中得以传承。