南京的地理环境决定后代帝王必定会掉入温柔乡
南京地处江南，气候湿润，经济发达，文化先进。在一个地方待长了人就容易产生惰性。如果朱棣不取代朱允文，朱允文肯定不会迁都北京，那么在南京这种文化环绕、诗歌荟萃的温柔乡里，后代帝王必会越来越不思进取，必然会再出现陈后主、南唐后主那样的诗人、画家之类的帝王，天天风花雪月、醉生梦死。
宋朝的皇帝为什么不思进取，抛开其他因素我觉着与开封、杭州过于繁华有关，好日子过习惯了谁还去想过穷日子，且不说北宋还有过一段相对和平的环境，就是南宋在金兵压境大乱当前的环境下，朝廷君臣照样醉生梦死只管享受。
当然了每个朝代的京都都比较繁华，但南京不一样，南京过于靠江南，没有长安、洛阳那样靠近西北还能沾染上点胡人的豪爽之气，南京纯粹是温软之风，风流才子遍地，歌楼酒肆争鸣，十里秦淮河更是出名的红灯区，纯粹是温柔窝、风流乡。看看在南京定都的几个朝代，东吴、东晋、宋齐梁陈，以及后来的南唐，那一个传久远了。因此即使朱允文靠谱有作为，他的儿子、孙子就很难说了。
南京的地理位置不足以控全局
我国的地理位置是西北高、东南低，北方对南方有俯冲优势，而南方对则需要仰视，因此历史上大部分是北方统一南方，而南方北伐全胜的不多，除了朱元璋。南京地处江南，对南北、东北边关出事望尘莫及，而这两个方向偏偏是历朝历代的大敌所在。朱元璋在世时已经认识到这个问题，并派太子朱标到西安、开封去实地考察，可朱标身子骨弱，回来后便得病死了。同时朱元璋在南京起家，不太愿意离开龙兴之地，加上岁数大了，折腾不起了。
在明初崛起之时，兵峰可直达西北，对长城一线的边关进行有效的控制，但随着国内稳定、惰性一起，朝臣们就会看不到敌人，政府运转效率便会出问题，往西北、东北运兵就会有困难。再加上江南文化先进，明清科举中举的大部分是江浙人，朱允文又是被江南大儒环绕，帝都所在地必然会形成巨大的江南利益集团，时间一长肯定会绑架朝廷，形成局布利益，导到全国出现不平衡，就象明朝未期的东林党一样。
蒙古大敌所在
虽然朱元璋时代灭了元朝，并对蒙古进行深入打击，但蒙古势依然强大，朱棣登基后没几天便出蒙古入侵，无奈朱棣只好亲自上阵，长驻北京，南京让太子监国，朱棣更是五征漠北，但到了明英宗时位然遭土“木堡之变”的惨剧。
即使朱棣不反，但在朱允文削藩的大政下，朱棣朱权必然会离心离德，那在防御蒙古上就不会全力以赴。假设朱允文不削藩，朱棣朱权也会尽力守边关，但到了儿子辈孙子辈会出现啥变故也很难说。
明承宋制，实际上还是重文轻武那一套，在朱棣“天子守国门”的方针下，后代皇帝还能感受到压力，朝臣们为了身家性命还能尽心尽力做好长城一线的防御，那么朱允文及子孙们长期待在南京会怎么样？边关守备必然日渐疏散荒废，一旦蒙古入侵，必然守不住，那么就会打过北京进入中原，宋朝的历史便会重演。
总之，朱棣若是不取代朱允文，明朝在两三代后必会出现变局。若要想长久，就必须在朱允文及其子孙中出现二三个大有作为的明君，迁都北京保持大明发展的势头，才能长久的走下去。