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长期投资审计是通过审阅、核对、盘点、询征等方法，对长期投资增减变动及实有数额等方面进行的审查和评价。其具体审查内容主要有：内部控制制度健全性和有效性的评审，期末余额真实性和正确性的验证，投资业务合法性和正确性的审查，收益的合规性和正确性审查等。
以公司产权登记及重大投资项目决策等资料为线索，重点审查:长期股权投资会计核算方法是否符合国家会计制度规定，有无人为调节资产现象；从资金流向入手，检查有无将投资损失长期挂帐或转嫁给“三产”单位。
（一）确定被审计单位的长期投资内部控制制度是否健全有效；
（二）确定被审计单位的长期投资在资产负债表日确实存在；
（三）确定被审计单位在特定期间发生的长期投资业务均已记录完结，没有遗漏；
（四）确定被审计单位资产负债表中的长期投资确实为被审计单位所拥有的；
（五）确定被审计单位长期投资的计价是否合适；
（六）确定长期投资投资期末余额是否按照长期股票投资、长期债券投资和其他长期投资的合计数填列；
（七）确定长期投资在会计的表上是否恰当披露。
长期投资是指不准备随时变现并且持有时间超过1年的投资。投资单位一般要承担相应的投资风险。因此审计人员在实施审计中如何对被审计单位的长期投资进行审计，应从以下方面重点把握：
一是通过检查相关投资合同和投资审批文件，检查投资是否经过批准手续，资金来源是否恰当，投资收益是否按规定纳税，投资报损是否有批文等，确认外投资及其取得的投资收益是否符合法律法规的规定。
二是通过检查投资协议、合同和相关审批文件，以及投资入帐的原始凭证，确认记录入帐的投资业务是否确实已经发生。
三是通过检查投资合同或协议，询问投资管理人员，结合对货币资金、投资收益的审查，确认特定会计期间内所有对外投资业务是否均已经记入有关帐户。
四是通过盘点有价证券、向被审计单位涵证及检查有关法律文书等审计手续，确认记入财务报表及相关帐户的投资是否在结帐日确实存在并归被审计单位所有。
五是通过检查投资明细帐，抽查原始凭证，复算有关损失准备的计价等审计手续，确认有关投资入帐价值及收益等事项是否以正确的金额记入了相关帐户，投资的计价方法是否符合现行会计准则的规定，前后期的运用是否保持了一致。
六是检查被审计单位的长期投资是否被正确地分类，投资收益是否恰当地与其他收益相区别。
七是通过检查结帐日前后一定时期内的投资协议、合同和投出资金、实物、无形资产等证据，检查被审计单位发生的投资付款业务是否记录于正确的会计期间。
八是检查被审计单位长期投资帐务处理是否正确。
九是通过核对和复算等审计手续，确认财务报表及其附注是否按照会计准则的规定，正确反映和充分揭示了投资项目、投资期末余额、计价方法、投资收益等有关信息。
(1)股票投资：审查确认股票投资入帐价值是否按实际支付款扣除应收股利后的差额确定。核算方法：查明对被投资单位拥有实际控制权的股票投资核算是否采用了权益法；相反，是否采用了成本法。审查股票投资增减变动及其收益(损失)核算的帐务正确。
(2)债券投资：审查确认债券投资入帐价值是否按实际支付款计算，含有应计利息的是否扣除应计利息；查明债券溢价和折价在债券到期前采用直线法予以摊销的正确性。分类：查明对含有应得利息的债券投资其应计利息是否单独核算。债券投资增减变动及其收益(损失)核算的帐务正确性。充分揭示：审查确认会计报表说明了一年内到期的长期债券投资和期末债券的市价。
(3)其他投资：以实物和无形资产投资的是否以资产评估或合同协议认定的价值入帐。