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长期借入负债是指期限在一年以上的借入负债。商业银行长期借入负债一般采用发行金融债券的形式。
第一，筹资的目的不同。吸收存款是为了扩大银行资金来源的总量；发行债券是为了增加长期性资金来源和满足特定用途的资金需要。
第二，筹资的机制不同。商业银行吸收存款是经常性的、无限额的，而发行债券是集中性的、有限额的。在商业银行吸收存款中，商业银行没有主动性，存款的金额、期限、币种、支取完全取决于存款的客户意愿，发行债券的主动权则在商业银行手中，商业银行对于债券发行的金额、利率、偿还期限、发行范围拥有绝对的主动权。
第三，筹资的稳定性不同。存款的期限弹性很大，客户随时可能支取，银行要留有充足的支付保证金，使得存款资金的稳定性差；而债券有明确到期日，一般无需提前还本付息，债券资金的稳定性较好。
第四，筹资的流动性不同。除大额可转让定期存单外，存款的关系维系在存款人和吸存银行之间，一般无法转让，流动性差；金融债券一般不记名，可以在二级金融市场上流通转让，流动性强。
第五，筹资的成本不同。吸收存款，商业银行需要众多的营业机构和营业网点、营业人员，业务量大，单位资金的筹集成本高；而发行金融债券则可以采用电话、通过互联网在国内外销售，单位资金的筹集成本低。
但是，金融债券的发行数量、利率受到管理当局严格的限制，银行要承担较高的发行费用，而金融债券的流动性强弱也较大地受金融市场发育和完善、规范程度的制约。所以，越是金融市场不够发达和完善的国家，金融债券不仅种类少，而且发行数量也较少。
商业银行借助于发行金融债券筹集资金具有十分积极的意义。
第一，发行金融债券面向全社会，筹集范围广泛，不受商业银行所在地区资金状况、营业网点、人员数量的限制，可以突破商业银行原有存贷关系的限制。
第二，债券的利率较高、流动性强，对客户有较强的吸引力，有利于提高商业银行筹资的速度和数量。
第三，发行债券所筹集的资金无需交纳准备金，无形中会大大提高银行对筹集资金的利用率。
第四，商业银行可以依据资金使用的需要，有针对性地发行债券，使资金来源与资金运用在前线上保持对称，有利于商业银行资产负债结构的均衡。