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在知识环境中，开放、动态的知识生态系统必然随着个体和系统的知识活动表现为时间向度的复杂性和增长性，这种变化是基于知识个体与环境相互作用以及不同知识个体间的相互作用的相互适应结果，我们称之为知识生态系统的进化。
1.选择性。组织知识生态系统面临着进化目标的选择问题，包括知识创新预期选择、知识资源选择以及最佳知识服务体系选择等。知识生态系统进化必须要能够适应外界环境的变化，既要从外界环境吸收知识成果用以产生灵感，又要与知识环境保持良好的互动获取支持性资源，包括知识、政策、资金、人才等。在内部，要求组织必须分析现有的知识刨新能力，以市场或社会价值为标准，以增强组织核心竞争力为目标，客观公正地选择创新观点和思路构建知识生态系统进化的整体框架。
2.渐进性。在自然界生态系统进化是由低级到高级、由简单到复杂的发展，是在新物种新生与旧物种绝灭过程中进行的，由许多中间过渡类型连接起来，是间断性与连续性相结合的发展过程。知识生态系统进化同样呈现出渐进性、连续性，从最初产生于个体的知识学习、模仿到扩散到整个组织的合作与学习活动都需要组织、个体问逐步适应，才能以某种方式成为组织固有的资产提升竞争能力。
3.传递性。组织在长期运行过程中形成的文化特质、各种惯例、成员的交流模式都具有一定的稳定性，必然会或多或少的延续到新的知识生态系统进化过程中。在选择过程中，一些有利于进化的因素被予以保留构成知识生态系统资源和文化的重要组成部分传递到组织各个系统。
4.层次性。知识生态系统的进化总是从弱变强、从无到有，一般来说，知识生态系统进化总是首先发生在组织最活跃的部分——知识创新阶段。在这个阶段，新的需求与旧有的支持方式发生矛盾，提出进化要求，然后促使组织进行一系列的调控，并扩展到整个组织引起整个系统的群体性进化。
5.复杂自适应性。Gell—Mann(1994)认为CAS具有以下特征：a．系统是开放的，与环境有能量和物质交换；b．系统能识别其动态过程中的一些规律性；c．系统将无规律的信息作为随机信息处理；d．系统具有记忆、学习和产生对策的能力。Levin(1999)指出，CAS包含异质性、非线性、等级结构和流4大要素，它们是系统产生自组织行为的根本原因。按照学者们对复杂自适应系统的解释，知识生态系统无疑是典型的CAS，它通过知识资源、知识服务和知识创新与环境形成各种物质和精神交换。知识在系统中呈现网络流动，非线性是其重要的特征。
随着知识利用价值的转化以及知识不断创新，个体知识在经历孕育、产生、成长、成熟和衰老的生命周期过程中实现进化，并逐步被推广、融入到组织层面，推动知识生态系统进化水平的不断提高。组织内外不同知识交织形成特定的知识生态体系，也会经历幼年、成长、成熟、衰退和孕育类似的生命历程。在知识生态系统不同的发展阶段，知识环境特征、知识生态系统状态会有不同的表现。
生态系统内生物之间、生物与其环境之间的复杂关系构成了物种进化的背景，某一物种的进化受生态系统内其他物种和环境因素的制约，因此，物种在生态系统内的进化，表现为该物种与其他相关物种及环境的协进化t。生物界物种进化是物种与环境相互协调相互适应的结果，环境的急剧变化会促进物种的进化，而新物种的进入也会使生态环境发生改变(比如外来物种危害问题)。知识环境是知识存在、发生、成长、创新的重要物质基础和文化基础，一个人不可能使知识脱离它的社会环境，也不会从社会资源和对人有效用的社会知识中将它剥离出去。每一个知识生态系统都有一定的知识族群与其存在的知识环境相结合，进行知识资源、知识价值和知识物质的交流，从而达到知识创新形成知识进化的目标。在一个协作的环境(这一环境服务于共同的工作计划)中，依靠用户经验和通过被共享的行为，环境促进知识的获取。
从知识生态系统的覆盖范围和组成部分看，可以划分为宏观、中观、微观三个体系，每一个层次都可以成为完整的知识生态系统。因此，不同维度下的知识生态系统存在着差异明显的环境体系，不同区域、不同行业、不同组织对于知识环境的敏感程度有很大差异。整体来看，影响知识生态系统的主要因素包括6个方面：a．经济水平。知识生态系统的各个组成要素都需要一定经济水平的支撑，比如知识资源的获取、知识服务的技术实现、知识创新平台建设等；b．系统结构，包括知识生态系统组成部分是否有清晰的架构和各个功能层面的配置情况；c．系统文化，包括个体和系统的价值观、道德水平、文化创新性等；d．知识水平，包括物化的知识资源类型、各学科知识配置以及个体知识要素；e．技术条件，信息技术、知识管理技术等技术是知识生态系统正常运转的必要保障；f．社会资本，社会资本通过个人和组织网络积累诸如信任、地位、品牌资源，这种优质的社会资本能够带给知识生态系统更多的资源和机会，有助于提高进化的效率。