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生态资产评估是对生态资产特点和总量的总体评价与估测，是针对不同区域、不同尺度和不同生态系统，运用生态学和经济学理论，结合地面调查、遥感和地理信息技术’拍等一切手段，进行生态资产核算或综合估价，获得比较科学、客观的数据。
生态资产评估不完全等同于经济学意义上的资产评估．经济学上的资产评估主要是经济实体的价值评估，为生产和生活服务；生态资产评估是以生物资源为主要对象的区域生态系统质量状况的评估，是生态保护和生态系统管理的一部分，为保持良好的区域生态环境而服务．生态资产评估的价值量核算部分不能简单地认为就是绿色GDP核算．绿色GDP包括资源核算和环境核算。柏；而生态资产评估的价值量核算部分包括生态服务价值和生物资源所提供产品的价值，是整个区域生态系统的综合测定，它可作为绿色GDP核算的一部分。
生态资产评估主要体现在资产价值方面，对生态资产的存量与流量给以关注，是生态学与经济学相结合的产物．生态系统评估更侧重于生态系统结构及其生态产品和服务功能等。
传统主流经济学对物品和服务的价值由市场的需求与供给均衡所决定。自然物品和服务的价值就没有纳人价值的计量体系中，因为它们即使有效用，也没有稀缺性、劳动投人和市场机制。随着人类经济系统结构和功能上的不断完善，经济运作对生产要素(土地、劳动力和资本)投人的要求就愈加广泛，配置方式也13益精密，要素的价值表现形式也日趋多样化，原来许多不被认为有价值或价格，而且在经济过程中似乎并不起主要作用的物品或服务变得越来越重要，即使没有规范市场的存在，许多并不为人类提供经济产品的生物种类，由于人类对其作用或功能的发现和了解的广度和深度的增加而逐渐被赋予了价值或使用价值，同时，因为随着人类社会经济活动的不断加剧所产生的对它们的各种胁迫而变得具有了“稀缺性”，稀缺使价值的交换和转移成为可能，为交换价值的产生和表达奠定了基础。
根据生态经济学、环境经济学和资源经济学的研究成果，生态资产评估的方法总体可分为四大类：(1)直接市场法，包括市场价值法、机会成本法；(2)替代市场技术，包括费用支出法、旅行费用法、享乐价格法；(3)创建市场技术，又称条件价值法，包括防护费用法、恢复费用法、影子工程法；(4)空间一能值分析技术，包括生态足迹法、能值分析法等。下面介绍几种常用的评估方法：
(1)市场价值法。市场价值法适用于没有费用支出，但有市场价格的生态资产的价值评估。例如没有市场交换而在当地直接消耗的生态资产，这些生态资产虽发有市场交换，但它们有市场价格，因而可按市场价格来确定它们的经济价值。市场价值法先定量地评价某种生态资产的生态服务功能效果，再根据这些效果的市场价格来评估其经济价值。在实际评价中，通常有两类评价过程：一是理论效果评价法，首先计算该生态系统服务功能的定量值，如涵养水源的量、二氧化碳固定量、农作物的增产量；再研究生态服务功能的影子价格，如涵养水源的定价可根据水库工程的蓄水成本，固定二氧化碳的定价可以根据二氧化碳的市场价格；最后计算其总经济价值。二是环境损失评价法，这是与环境效果评价法类似的一种生态经济评价方法，例如，评价土壤的生态资产价值时，用生态系统破坏所造成的土壤侵蚀量及土地退化、生产力下降的经济损失来估计。
(2)条件价值法(又称假设市场法)。它以人们对某种生态资产的支付意愿来表达生态资产的经济价值。例如人们为选择环境友好的产品支付的费用，或者人们愿意为一个生态环境优美的湖泊而支付的费用。它能通过人们的主观判断，评价各种生态系统服务功能的经济价值，包括直接利用价值、间接利用价值、存在价值和选择价值。
(3)恢复费用法。当某生态环境资源遭到破坏，将其恢复到原有状态所需的费用作为该生态资产的价值。这种方法常用于环境损害的评估。
(4)能值分析法。任何物品或服务的形成过程中直接或间接使用的各种能量的总量，就是该物品或服务的能值。能值分析理论是从系统生态角度来研究分析不同时间和空间尺度下的自然和人类一自然生态系统的能量经济行为的方法。