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报关单预录入是指报关单位或报关人将报关单上申报的数据、内容录入电子计算机，并将数据、内容传送到海关报关自动化系统。
根据电子数据的三种申报方式，电子预录入方式也相应有终端录入、EDI录入、中国电子口岸报关单预录入／申报系统(简称H2000)录入三种方式。海关计算机系统升级更新后，将主要采用H2000通关系统。报关员对预录入人员录入的报关单电子数据要与自己手写填制的报关单各栏目内容进行核对，审核无误后才能向审单中心发送。否则，出现报关单填制错误由报关员自己负责。
1．发送数据至海关审单中心
报关员在对电子数据进行核对后，指示预录入人员将电子数据发送至海关审单中心。
海关在审核电子数据报关单时，对进出口报关单有关栏目有疑义，需要进出口货物的收发货人、受委托的报关企业进行解释、说明情况或补充材料的，收发货人、报关企业应当在接到海关通知后及时进行说明或提供完备材料。
2．特殊申报
(1)海关批准的便捷通关企业，可以在进出口货物的品名、规格、数量等已确定无误的情况下，在进口货物启运后、抵港前或出口货物运入海关监管场所前3日内，提前向海关办理报关手续，做无舱单申报。
(2)需要申请缴纳保证金或出具保函办理海关手续的，需在电子申报之前，填写《缴纳保证金申请书》或《保证函》，经海关审批同意后，方可申报。
(3)展览品进出境货物，需在电子申报之前，凭已录入并打印出的报关单，经海关相关业务部门审批后，方可申报。