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市场运作监管是指金融机构成立后，对其日常的市场经营运作所进行的监管。
对金融机构市场运作监管的具体内容，在各国之问并不完全相同，但一般都将监督管理的重点放在金融机构业务经营的合规性、资本充足性、资产质量、流动性、盈利能力、管理水平和内控机制等几个方面。
1．资本充足性监管
对于金融机构的资本金，除了要有符合规定的注册资本最低限额之外，一般还要求金融机构的自有资本与资产总额、存款总额、负债总额以及风险投资之间保持适当的比例，通过对金融机构实际资本比率、风险资本比率等资本比率的监管，可以达到以资本规模制约资产规模(特别是风险资产规模)，从而降低金融机构经营风险的目的。
2．流动性监管
各国金融监管当局对金融机构的流动性非常重视，既包括本币的流动性监管，也包括外币的流动性监管。同时，金融监管当局对流动性监管的方法不尽相同，在流动性指标的设计上存在差异。比如，有的国家分别设计了银行资产负债的比例，用以监督检查银行的清偿能力；又比如，有的国家并没有正式规定流动性的具体界限，却对银行的流动性进行经常的检查。
3．业务范围监管
对金融机构业务范围的限制程度，不仅与一国的经济、金融发展程度有关，而且与其金融监管水平、传统习惯等有关。对于金融机构业务范围的限制，各国并不完全相同，存在着一定的差异。在一些国家，商业银行的业务与投资银行的业务是分开的，商业银行不能认购股票；而有些国家限制银行对工商业的直接投资。有的国家禁止将银行业务与非银行业务混在一起，却允许通过银行控股公司、附属机构等方式，参与某些经营风险较大的非银行活动；有的国家允许银行经营非银行业务，但对其投资规模却有所限制。
4．经营活动监管
金融机构经营的直接目的，是追求最大限度的利润。因而，金融机构会尽可能地将吸收的资金集中投向盈利高的贷款与投资。但是，在盈利性提高的同时，经营风险也相对增大。各国金融监管当局都对金融机构的经营活动进行监管，通过对资产负债比例的管理、资本流动性管理等，限制银行贷款过度地集中，限制银行对单个借款者提供过多的贷款。
5．外汇风险管理
由于世界各国的金融领域开放程度不同，金融机构的国际金融业务发展状况和面临的外汇风险也就不同。有的国家对银行的外汇及外汇业务实行严格的监管，有的国家则实行比较宽松的管理。例如，美国、法国和加拿大等国家对金融机构的外汇及外汇业务的监管比较宽松，而英国、日本、荷兰和瑞士等国家则比较严格。
6．准备金管理
一般来说，银行的资本充足性与中央银行存款准备金政策之间存在着一定的内在联系，金融监管当局在对银行的资本充足性进行监管时，必须考虑银行准备金的计提问题，确保银行准备金是在充分考虑谨慎经营和真实评价业务质量的基础上的提取，避免准备金提取不实所掩盖的潜在风险。在世界各国金融相互开放和跨国金融机构快速增长的情况下，各国中央银行准备金政策和准备金提取方法的统一，已成为增强国际金融体系稳定性的一个重要因素。
7．存款保险管理
在有些国家，金融体制中建立了存款保险制度。当本国金融机构由于经营不善或受外部环境变化等各种因素影响而出现信用危机时，存款保险机构将向金融机构提供财务支援，或者由存款保险机构直接向存款者支付部分或全部存款，以保护存款者的利益，维护正常的金融秩序。存款保险制度的建立，对促进一国金融业的稳健发展具有一定的积极作用。
8．其他方面的监管
金融监管当局还通过各种方式对金融机构的其他方面进行必要的监管。例如，在市场经济条件下，利率作为货币资金的价格反映着信用资金的供求状况，并随着市场供求的变动而变动。但是，为了防止金融机构之间恶性竞争的发生，保证金融体系的稳定与效率，金融监管当局在遵循市场规律的基础上，对利率进行统一的监管就存在必要性。中央银行对利率的监管，主要是依法确定基准利率。