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酵母杂交Tips6 顺式作用元件怎么看?水稻拟南芥转录因子文库筛选

想通过酵母单杂交筛选上游调控因子,该如何选择单杂交诱饵序列呢?选了启动子后,但是启动子上元件很多,如何查询元件功能,选择关键motif?

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酵母单杂交诱饵选择方法(Y1HGold-pAbAi系统)

1. 启动子片段形式:选择感兴趣元件比较集中的区域(建议200-300bp左右);

2. motif形式:选择感兴趣motif进行串联。

注意事项:插入序列中不要同时含有BstbI/BbsI

02

常用的启动子预测软件

(Plantcare顺式作用元件预测结果示例)

(NEW PLACE顺式作用元件预测结果示例)

温馨提示:由于不同建库材料基因表达的时空特异性差异,以及转录因子在总转录水平中的占比较低(约3-5%),推荐所研究的诱饵与建库取材的表达谱相匹配,更有助于通过单杂交技术筛选上游调控因子。

水稻/拟南芥转录因子家族文库筛选

原创声明:本文由欧易生物(OEBIOTECH)学术团队报道,本文著作权归文章作者所有。欢迎个人转发及分享,未经作者的允许禁止转载。

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