宫古岛和那霸岛原属于琉球国群岛，1609年，日本萨摩藩入侵琉球之后，琉球成为萨摩藩的附庸国。萨摩藩派遣官员监督琉球的内政，而另一方面萨摩藩出于经济利益上的需要，表面上仍将琉球看作是一个国家，要求琉球继续奉中国为宗主国，并向中国朝贡以从中获取巨大经济利益。1609年，日本萨摩藩入侵琉球之后，琉球成为萨摩藩的附庸国。萨摩藩派遣官员监督琉球的内政，而另一方面萨摩藩出于经济利益上的需要，表面上仍将琉球看作是一个国家，要求琉球继续奉中国为宗主国，并向中国朝贡以从中获取巨大经济利益。1872年，日本宣布琉球国为“日本领土”，封琉球国王尚泰为“琉球藩王”，把琉球国改为日本琉球藩，史称“第一次琉球处分”。
1879年3月11日第二次琉球处分后，琉球藩被废除，编入鹿儿岛县，同年设置冲绳县。自此，琉球被日本并合，原琉球国之领土被分别划入冲绳县和鹿儿岛县。宫谷岛作为琉球的宫谷群岛中最大的一个，距离冲绳岛约300千米。行政区划属于冲绳县宫古岛市。全岛面积158.87平方千米，周长117.5千米，最高点海拔114.8米。
日本对琉球的吞并引起了不少琉球人的反抗，以及当时清朝政府的抗议，后来在磋商后于1879年日本方面提出“分岛改约案”，愿割宫古、八重山两岛给中国，中国曾考虑接受此案，让琉球国王在此地复国。但毛精长、蔡大鼎、林世功等人再三诉愿表示二岛土地贫瘠，无法生存，表示不能接受。1894年，中日甲午战争爆发。与日本签订《马关条约》，台湾割让给日本。日本占领琉球成了定局。从这算宫古到并入日本已经125年了。而那霸岛实际上1879年就已经被日本侵占，距今已经140年。
