在过去的十年中,RNA-Seq技术迅速发展,因为能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,所以广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。由于RNA本身不稳定,而mRNA只占抽提总RNA的3%-4%,且RNA-seq最常用的磁珠富集法对于RNA的完整度要求也很高,所以,提取作为科研实验开始的第一步是十分重要的一个环节。
今天小欧就来为大家带来提取界的葵花宝典,一起来了解RNA提取液氮研磨组织时的注意事项吧~
一、液氮研磨重要性
1、 由于RNA的分子结构特点,RNA极易降解,液氮可以使样本组织瞬间达到低温状态,抑制组织内源性RNase降解RNA;
2、 由于液氮极低的温度可以使样本组织和细胞都变得很脆(对,就是嘎嘣脆的那种~),通过研磨便于细胞的破碎,释放出细胞内部的核酸;
3、组织的匀浆过程是RNA提取是否成功的关键步骤之一,液氮研磨可以保持组织在匀浆过程中持续处于低温状态,防止研磨过程中RNA的降解;
二、液氮研磨的原理(研钵)
液氮的温度为一196℃,它既能使各种组织成分不易被破坏或降解(终止细胞内外一切生物反应,又能使组织变硬,脆性增加易于磨碎)。
三、液氮研磨流程
1. 灭菌
研钵的灭菌180度烘2h,每份样本使用单独的研钵、镊子、剪刀等取样工具,防止交叉污染,且取样工具需要远离垃圾桶,防止污染样本。
2. 预冷
1) 用记号笔在收集管盖上和管壁上,都写上样品名称;
2) 将样品、收集管、勺子放在液氮中预冷;
3) 将液氮小心加入并浸满研钵,浸泡预冷研杵与研钵(加入液氮时,缓慢加入,防止液氮飞溅),一般加两次液氮就很好的预冷了。
3.放入组织
将组织迅速转移至液氮内,确保组织全部浸没在液氮中。
4.破碎
使用研杵在液氮中轻轻敲打组织,将组织打碎成小块,要注意切勿用力过度,要防止组织块飞溅出研钵;在液氮即将挥发完时,使用研杵对组织样本进行碾压研磨。注意研磨过程要朝着一个方向研磨。
5.中途补充液氮
待液氮挥发完后,立即加入1/3研钵体积的液氮(注意,加入液氮速度要缓慢,切勿使得液氮冲击力过大,将组织样本冲出研钵)。
6. 充分研磨2-3次
迅速用研杵研磨组织,根据组织状态的变化程度,在确保组织始终处于冰冻状态下,及时补充液氮进行研磨,直至组织被研磨成粉末状。
7.收集聚拢样品
最后再补充一次液氮聚拢粉末,用勺子搅拌粉末,待液氮挥发完全粉末泛白。
8.装取样品
用长镊子取出液氮中的样品收集管,用勺子挖取适量粉末样本至收集管中,且要注意,手指不要捏住收集管的管底,要抓住管口的位置,收取后盖好盖子并迅速投入液氮保存;剩余多余样品收集至合适的样品管中,也要迅速投入液氮。
四、注意事项
1.个人防护:佩戴棉手套,注意液氮飞溅冻伤;液氮、裂解液均对人体有危害,注意避免直接皮肤接触,禁止在该实验中穿短裤、凉鞋等会暴露皮肤的服装,必要时可以带上护目镜以保护面部安全;
2.勺子离心管需要预冷;
3.研磨过程中使用的器材均需灭菌;
4.研磨程度越细越好。
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