代谢物鉴定金标准：
什么叫可信代谢物？简单来讲，通过多维度的匹配后能相对较为准确的得到注释的代谢物，这些代谢物就可以成为可信代谢物。那么多维度是指的那些维度呢？一般情况下，基于液相色谱质谱的非靶向代谢组学目前鉴定和定性的维度有三个：RT（Retention time）保留时间；MS1（一级质谱）；MS2（二级质谱）。
接下来给大家介绍一下三个维度的相关内容：
RT：保留时间，是指从进样开始到某一组分浓度达到最大值所需要的时间；简单点说，就是该物质的实际出峰时间，理论上来说，相对稳定的色谱质谱联用仪，在色谱柱以及流动相等体系一致的情况下，单个代谢物的保留时间长时间内应该稳定在某个数值的较窄波动范围内；
MS1：一级质谱，一般指的是检测到的带电离子的质荷比，在代谢组学的质谱检测过程中，一级质谱和代谢物的分子离子峰有着密切的关联，通常我们称此联系为离子加和模式，理论分子量通过某种离子加和形式得到的就是我们常说的一级质谱（MS1）,在代谢组数据中，通常用来评价代谢物鉴定准确度的一级质谱信息为质荷比的质量精度，即实际检测的化合物的MS1和理论上的质量数进行质量精度的计算，所以一般来说，控制一级质谱的质量精度就能控制代谢物鉴定的准确度，质量精度越小，误差越小。
MS2：二级质谱：按照一定的规则进行母离子的选择，再把选择后的母离子进行碰撞打碎后得到的质谱碎片即为该母离子的二级质谱；目前高分辨质谱使用较为常见的母离子选择的规则为DDA采集模式，即数据依赖性采集模式，采集规则通常为按照采集到的一级质谱（母离子）的信号强度排列，将Top N的一级质谱选择设置进行打碎，再采集其对应的二级质谱碎片，目前二级质谱是高分辨液相色谱质谱进行代谢物鉴定最常用的维度之一；
经典文献中关于代谢物鉴定标准的示例：
CELL | 孕妇的新陈代谢可预测妊娠年龄和分娩时间
文中关于代谢物鉴定的描述如下所示：
Gut Microbes | 以粘蛋白聚糖为食的活泼瘤胃球菌在肠道和大脑通讯中的作用
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Cell Metabolism | 菌群的脯氨酸代谢改变影响抑郁症
文中关于代谢物鉴定的描述如下所示：
Nature Aging | 极长寿老人宏基因组和代谢组的重塑及其与遗传和社会经济因素的关系
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CELL | COVID-19重症患者血清蛋白质组学和代谢组学生物标志物筛选
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