正如所有的医疗程序一样，维生素K的注射也是有风险的。婴儿接受注射维生素K会增加新生儿发生黄疸的风险。
许多孩子注射维生素K后出现了严重的黄疸疾病，并且需要光线治疗法和其他治疗来保护他们的健康。一些研究也表明，注射维生素K与患白血病和其他儿童癌症发病率之间也有一定的联系。虽然一些研究反驳了这些发现，但注射维生素K导致儿童患白血病的风险高达80%还可能会增加。而且如果新生儿注射维生素K超过正常水平，也可能会干扰正常的细胞分裂和生长。
因此对于许多孩子来说注射维生素K也是痛苦的，这就足以让父母拒绝给孩子注射维生素K。
