伦敦大学学院(UCL)的研究人员领导的一项新研究发现，为个别病人定制全基因组测序分析可使罕见疾病的诊断率提高一倍。英国卫生部在2018年宣布了一项国家卫生服务（NHS）基因组医学服务，该服务允许罕见疾病患者读取他们的整个基因代码，希望能提供急需的诊断。
然而，对这些数据的解释可能异常具有挑战性。事实上，许多患有复杂、罕见遗传病的人仍然没有得到关于其问题原因的分子答案。
在这项研究中，研究人员试图为这类患者提供一个更好的机会，让他们接受基因诊断。这项研究是在UCL皇后广场神经学研究所的伦敦线粒体中心和UCL大奥蒙德街儿童健康研究所进行的，其结果将于今天（11月7日）发表在《自然通讯》杂志上。
为了实现他们的目标，研究人员测试了使用由专业医生、生物信息学家和科学家组成的基因组医学团队如何能够提升NHS诊断实验室的能力，使其超越标准的半自动化数据分析。UCL团队重新评估了未诊断的病例，以确定可能有助于指导进一步、更个性化分析的线索。他们随后应用了额外的生物信息学方法，使用先进的计算机技术来识别患者DNA中可能导致疾病但在常规测试中被忽略的基因改变。
该研究的参与者包括102名未被诊断的患者，他们被怀疑患有原发性线粒体疾病（一大群影响儿童和成人的不可治愈的遗传疾病，与广泛的医疗问题、严重残疾和寿命缩短有关），他们通过国家卫生系统的10万个基因组项目进行了全基因组测序。
这种个性化的方法将诊断率从16.7%提高到31.4%。它还在另外3.9%的患者中发现了潜在的致病变体。
主要作者Robert Pitceathly博士（伦敦国家医疗服务系统罕见线粒体疾病高度专业化服务的共同负责人和UCL皇后广场神经学研究所的研究小组负责人）说。"NHS在先进的遗传技术方面进行了大量的投资。因此，英国已经确立了自己在诊断性全基因组测序方面的领先地位。也就是说，一些患有罕见遗传病的人在他们的基因组被分析后仍然没有得到分子诊断。我们相信投资于专业的基因组医学团队是至关重要的，它可以确保公平地获得专门的多学科专业知识，并最大限度地提高诊断率。在我们的研究中，患者平均等待诊断的时间超过30年--我们现在有能力解决此类案件，但需要足够的劳动力规划来支持NHS诊断基因实验室实现这一目标。"
接受基因诊断是很重要的，因为它允许患者获得生育计划当中专属的试管婴儿和药物试验的机会。它还可以允许对已知的疾病并发症进行有针对性的筛选，并获得药物研究的机会。
Pitceathly博士说。"在这项研究中，每一个新的基因诊断都对病人护理产生了直接影响。这包括对心脏问题、听力损失和糖尿病的额外检查，以及获得临床试验的机会"。
UCL皇后广场神经学研究所所长Michael Hanna教授说。"这项工作是在开发使基因组分析为患者带来最大利益的最佳方法方面迈出的重要一步。它清楚地表明，通过将基因组分析的自动化方法与熟练的多学科团队的数据解释相结合，诊断率会翻倍。这是一个重要的发现，它将影响基因组医学诊断服务在世界范围内的发展"。
共同作者詹姆斯-戴维森博士（大奥蒙德街医院代谢医学部，英国遗传性代谢疾病小组主席）说。"对于患有罕见、复杂疾病的儿童和成人来说，达成诊断的过程可能非常漫长，而基因组医学在帮助达成这一目标方面提供了一个变革性的强大工具。这项研究强调了专业临床医生和遗传科学家在解释基因组测序结果方面的合作的重要性，以最大限度地增加达成诊断的机会，然后帮助指导医疗管理和治疗方案。"
患者故事
Rachel North是参与该试验的患者之一，她将获得诊断描述为"改变了生活"。此后，它让她接受了疾病并发症的筛查，如骨质疏松症，这些都得到了治疗。
她说。"在过去的20年里，我去了那么多医院，找了那么久，我从来没有想过我会得到准确的诊断。思考这个问题占用了很多精力，我担心我12岁的儿子，担心我的病情是否会影响他。因此，得到罕见隐性遗传的诊断是一种解脱，消除了对未知的恐惧。有了诊断，我就可以研究我的病情，并非常主动地管理它。任何能帮助我了解和理解发生在我身体上的事情的东西，都能帮助我接受它，并给我信心，我正在尽可能地管理它。"
