主要通风机的工作方式有压入式、抽出式和压抽混合式三种。(1) 压入式。主要通风机安设在进风井口，在压入式主要通风机的作用下，整个矿井的风流均处于正压（高于当地大气压力）状态。采用压入式通风，需要在进风路线上设置较多的通风构筑物， 使通风阻力增大，通风调节困难，而且漏风较大，通风管理也比较困难。
(2) 抽出式。主要通风机安设在出风井口，在抽出式主要通风机的作用下，整个矿井的风流均处于负压(低于当地大气压力）状态。采用抽出式通风，在主要进风路线上无须设置通风构筑物，通风阻力较低，便于运输、行人；外部漏风量少，通风管理容易。与压入式相比，抽出式通风不存在向下水平过渡时期改变通风方法的困难。
其缺点是当地面存在小窑塌陷区并和开采区裂隙沟通吋，抽出式通风会将小窑中积存的有害气体抽到井下，并使工作面有效风量减少。目前中国矿井普遍采用抽出式通风。(3) 压抽混合式。在进风井口设一台风机进行压入式通风，在出风井口设一台风机进行抽出式通风。
通风系统的进风侧处于正压状态，回风侧处于负压状态。若工作面大致处于中间，其正压或负压均不大，连通地表的采空区漏风小。但使用的通风机设备多，通风管理复杂。压抽混合式通风，由于采空区漏风小，适用于自然发火严重的矿井。同时在通风阻力大、风量要求高的矿井，当受现有通风机能力的限制时，可采用压抽混合式通风。
一般新建矿井不宜采用。对于新建矿井，矿井通风系统的选择，事实上在许多情况下, 几种通风系统都可以考虑，很难确定哪一种最好，必须通过技术经济比较后再行决定。