吉星鹏是中国羽毛球队第一位奥运男单冠军（2000年悉尼奥运会），退役之后进入国家队教练组，并担任二队的男单主教练。2007年世锦赛之后，为了让国家队更好地备战北京奥运会，吉新鹏和张军、刘永以及夏煊泽一起调整进入国家一队教练组，其中吉新鹏进入男单组。题主所提的吉新鹏与林丹之间的冲突，应该是当时的“殴师门”事件，最终导致吉新鹏离队。我们不是当事人，也不是目击证人，林丹到底有没有殴打吉新鹏扑朔迷离，已成为历史问题，知情人我想也只有吉新鹏、林丹、李永波及几位队友了。
“殴师门”事件原委（媒体报道）北京奥运会前中国羽毛球队进行了汤姆斯杯前的队内比赛，分成A、B两组进行五局三胜的对抗(包括单、双打)，其中男单的林丹、陈郁被安排在一组，而鲍春来、陈金在另一组。
尽管率先上场的林丹以2:1赢了陈金，但其所在的一组最终败给了另外一组。林丹将所在组的失利归咎于吉新鹏在男单分组方面的问题。赛后，正当吉新鹏与老帅汤仙虎谈事时，林丹怒气冲冲地喊道：“吉导……”第一声，吉新鹏发现其语气有些不对劲，没有理睬他，继续与汤仙虎聊着。第二声，吉新鹏才朝着林丹的方向走去，并质问：“你叫什么叫……”林丹怒斥为何给男单排出这样的出场次序，吉新鹏解释这是钟波(男单主教练)安排的，他只是遵照执行而已。一阵口角后，林丹竟挥拳打向吉新鹏的身体，正当他挥第二拳时，被其他队员劝阻了。而吉新鹏在遭到突然袭击后，始终没有还手。
“殴师门”事件最终处理结果（媒体报道）正当所有人都以为此事会很快翻篇，但却不料事发第3天，有媒体将此事披露出来，而更让人惊讶的是报道媒体是当天并不在场的一家深圳媒体。随后一则“球队内部吵架”新闻逐步演变成“殴师门”恶性事件，甚至有人开始攻击李永波管理队伍松散，当李永波意识到事态发展日趋严重后，找到吉新鹏要他出面解释，不过得到的回答是：“我要征求一下我家人的意见。”
随后事态的发展远未结束，声称向家人征求意见的吉新鹏随后突然“完全消失”，直至几天后，他自己在博客中更新博文，在发表的《我的回答》文章中称：“林丹已对我做出道歉，为了国家利益、队伍安定团结，这件事情已经过去了。”
同样，作为事情的另一主角，林丹此时的日子也不好过。李永波在找吉新鹏谈话后找到林丹并告知：“这段时间可能矛头都会指向你，但你别因为这些事情太过分心，好好备战。”而对于林丹而言，他最想不通的就是2007年关系甚好的两人怎么就在一年后集训闹成如此。
最终事件的始末被调查清楚，听说也许是事发后吉新鹏给家人打电话，可能说道“今天特别不舒服，和林丹吵起来了”，甚至可能提及“小队员还想上来动手”。而让人意想不到的是消息被捅给了不知情的媒体，最终导致本可关门内部解决的小火苗被扩大成一场灾难。
后来李永波也问吉新鹏“你了解你的家人吗？”不过无论怎样，“殴师门”事件的确伤害了整个羽球队，而吉新鹏在队伍最需要他时选择消失也伤害了他和队伍间的感情，事发后队员很难再和他心贴心交流，教练和队员之间失去信任，对队伍、对吉新鹏都是损失，最终吉新鹏不得不离开国家队。
经过这些争吵和误解，林丹也在反思：时代不同了，教练与队员之间沟通的方式也发生了巨变。
个人观点作为当事人，林丹曾发表声明：“我根本没有打人，也不可能去打教练吉新鹏。”对于“殴师门”事件中林丹拳打吉新鹏真伪我们无从判断。但我们就是论事，如果说林丹真的打过吉新鹏，那确实是林丹的错，北京奥运会前林丹还不是奥运冠军，充其量仅是世界冠军，太年轻气盛了。2008年韩国公开赛林丹向李矛扔球拍就发生过恶劣影响。如果说这件事确实是真的，那么林丹辉煌的羽毛球职业生涯将染上污点。