医疗废弃物焚烧炉采用热解气化技术，通过空气量的控制，实现分级燃烧。第一燃烧室内为贫氧燃烧，部分垃圾燃烧产生的热能为另一部分垃圾的热解提供了能量，并可使固定炭燃烧完全。
两级燃烧室的高温燃烧，能够达到彻底灭菌、消毒、除臭的目的，同时配置热能回收系统，尾气处理系统，构成运行可靠的烟气处理系统，无二次污染。
具体的工艺流程为：
1）、废料由液压推杆输送进入回转窑头，物料顺向流向窑尾。
2）、物料在燃烧助燃作用下焚烧，回转窑产生的烟气进入二次室内，焚烧产生的灰渣经湿法刮板机自动排出。
3）、焚烧产生的烟气在二次燃烧室经天然气助燃进一步高温焚烧，燃烧温度增加到1100℃-1200℃，使焚烧更完全，达到无烟、无臭、无二次污染的效果。
4）、二燃室出来的烟气进入余热热水换热器，加热软水供生产工艺使用。
5）、余热热水换热器出来的烟气进入半干式急冷塔。通过喷水降温来控制温度在1s内迅速降低到200℃左右，从而有效地抑制了二噁英的再生成。
6）、随后烟气进入干式除酸及二噁英吸收装置，进一步净化尾气。喷入消石灰的作用是去除吸收烟气中的HCl、SOx等酸性成分，活性炭的作用是吸附去除烟气中残留的少量二噁英呋喃等。
7）、尾气进入气箱式布袋除尘器，去除烟气中滞留的细微粉尘。在布袋除尘器进口温度不在限值范围时，布袋旁通电磁阀打开，烟气由旁通进入烟囱，确保烟温异常时不对布袋形成致命破坏。
8）、从布袋除尘器出来的烟气进入喷淋洗涤塔和湿法填料洗涤塔装置，主要功能是进一步脱除洗去烟气中的酸性气体后通过烟囱排放。