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31篇肿瘤领域单细胞测序文章盘点之头颈肿瘤和泌尿系统肿瘤领域

时间:2022-10-11 14:55:42 热传 我要投稿

截至2022年8月,单细胞在肿瘤领域合作的研究硕果累累,助力发表31篇肿瘤领域单细胞文章,平均IF达12.62。

之前,生殖系统和神经系统肿瘤的合集意犹未尽,这一次来看看头颈肿瘤和泌尿系统肿瘤的文献合集吧~

头颈癌:

单细胞RNA测序剖析原发性和复发性鼻咽癌微环境的异质性

Dissecting the heterogeneity of the microenvironment in primary and recurrent nasopharyngeal carcinomas using single-cell RNA sequencing

发表期刊:OncoImmunology

影响因子:7.723

材料:4例原发性鼻咽癌和2例复发性鼻咽癌

文章概述:鼻咽癌(NPC)10-15%的复发率,目前没有长期的治疗方案。研究分析了原发性鼻咽癌和复发性鼻咽癌(rNPC)免疫细胞和肿瘤细胞的异质性。该研究有助于设计有效的抗癌治疗,特别是免疫治疗方案。研究为揭示rNPC免疫微环境提供了重要线索,有助于推进rNPC的靶向免疫治疗。

单细胞转录组分析揭示视网膜母细胞瘤肿瘤内异质性和恶性进展

Single-cell transcriptome profiling reveals intratumoural heterogeneity and malignant progression in retinoblastoma

发表期刊:Cell Death & Disease

影响因子:9.685

材料:两个视网膜母细胞瘤样本

文章概述:视网膜母细胞瘤是一种儿童视网膜肿瘤,是最常见的原发性恶性眼内肿瘤。该研究揭示了多种肿瘤相关通路的细胞组分以及UBE2C与肿瘤恶性进展的激活态相关,为人类视网膜母细胞瘤早期进展的关键阶段提供了一个潜在的“开关基因”标记。该研究提高了目前对视网膜母细胞瘤进展机制的理解,并提供了一种视网膜母细胞瘤新的预后标志。

转录因子c-Maf控制小鼠和人的差异代谢需求决定先天γδT17的功能

Differential metabolic requirement governed by transcription factor c-Maf dictates innate γδT17 effector functionality in mice and humans

发表期刊:Science Advances

影响因子:14.957

材料:两例配对的口腔癌和癌旁组织

文章概述:细胞代谢可以调控γδ T细胞的功能,但潜在的分子机制仍不清楚。研究发现转录因子c-Maf通过直接调控IDH2启动子活性来调控γδT17的功能。γδ T细胞中c-Maf的缺失降低了转移性肺癌的发展,提示c-Maf可能是癌症免疫治疗的一个潜在靶点。此外,c-Maf也控制外周血和口腔癌中的人γδ T细胞中IL-17的产生。研究表明,转录因子c-Maf通过IDH2介导的代谢重编程在调节γδT17效应功能中发挥了关键作用。

泌尿系统肿瘤:

单细胞RNA测序强调炎性肿瘤相关的成纤维细胞在膀胱尿路上皮癌中的作用

Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in bladder urothelial carcinoma

发表期刊:Nature Communications

影响因子:17.694

材料:8例膀胱癌肿瘤样本(2例低级别和6例高级别)和3例配对癌旁样本

文章概述:膀胱癌是世界上最常见的泌尿生殖系统恶性疾病之一,每年约有430,000新诊断病例和超过165,000的死亡病例。该研究发现肿瘤细胞低表达MHC-II类分子,揭示下调肿瘤细胞中免疫原性的功能可能有助于形成一个免疫抑制的微环境。髓系亚群LAMP3+ DC可能通过CCL17和CCL22通讯作用关系招募Treg细胞,参与形成免疫抑制微环境。此外,本文重点探讨了iCAFs的炎性作用,发现iCAFs与临床预后和肿瘤生长增殖等密切相关。以上结果阐明了iCAFs的作用机理,对膀胱癌的治疗提供了新见解。

5mC调控子分子亚型系统,描绘膀胱癌微环境特征并指导精准医疗

5mC regulator-mediated molecular subtypes depict the hallmarks of the tumor microenvironment and guide precision medicine in bladder cancer

发表期刊:BMC Medicine

影响因子:11.150

材料:1例BLCA根治样本(肌浸润性,高级别)和1个公开的BLCA单细胞数据集(GSE145137)

文章概述:膀胱癌(BLCA)是最常见的泌尿系统恶性肿瘤之一,BLCA的肿瘤微环境具有明显的异质性。尽管在免疫检查点阻断、新辅助化疗和靶向治疗方面取得了可喜的进展,但晚期BLCA预后仍然很差。本研究整合了湘雅队列和多个外部BLCA队列,开发了一种新的基于5-甲基胞嘧啶(5-Methylcytosine,5mC)调节子介导的分子亚型系统,并采用5mC评分作为定量评价指标。确定了两个5mC clusters,其评分可准确预测经典分子亚型、免疫表型、预后和多种治疗方案的疗效。

单细胞多组学分析揭示肾透明细胞癌的调控程序

Single-cell multiomics analysis reveals regulatory programs in clear cell renal cell carcinoma

发表期刊:Cell Discovery

影响因子:38.079

材料:三名肾透明细胞癌患者进行了配对的scRNA-seq和scATAC-seq,另外一名患者单独的scRNA-seq

文章概述:肾透明细胞癌(ccRCC)是肾细胞癌最常见和最具侵袭性的类型。该研究应用单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序揭示ccRCC的转录组和表观基因组特征。研究确定了由四个关键转录因子(HOXC5,VENTX,ISL1和OTP)介导的肿瘤特异性调控程序,这些转录组因子在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中具有预后意义。该研究深入了解了肿瘤异质性和潜在的调节因素,有利于未来选择更有效的临床治疗策略。

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