《西游记》中，通天教主出现了，只要梳理一下，就明白了：
第一，三清的称谓，变成了太上老君、元始天尊和灵宝天尊。通天教主，被鸿钧道祖带走，并且，鸿钧说封神大战主要过错在他，因此，他肯定要重新做人啊，再出现时，改号为灵宝天尊，再自然不过。
另外，三清被师父，法术更高一大境界，达到混元无极大罗金仙境的鸿钧道祖，喂下玄丹，如有异动，必死。
因此，到了《西游记》中，三清基本上清心寡欲，不与人争了。
第二，通天教主另一分身比较活跃。但通天教主是喜动不喜静的人，本尊灵宝天尊静着好了。但他人分身菩提祖师，却依旧教化九界众生，只不过，不大肆宣扬，低调罢了。
但客观讲，到孙悟空结业时，至少一千七八百年时间，又教化了不下万仙吧。没办法，人家就是明师，爱教徒弟，也能收到好徒弟。
第三，截教的人，很活跃。一是多宝道人换号如来佛祖，统领佛界；二是金灵圣母换号斗姆元君，统领神仙众星；三是无当圣母化名黎山老母，整合好了截教势力；四是龟灵圣母最终修炼回本体，在通天河为主；五是，这四方截教势力联合起来，把牛魔王占据的原截教地盘，十几座大山啊，给拿了回来。牛魔王一家，也被迫归降了。
你细读，《西游记》虽然没正面描写截教和通天教主，但人家们办的事情，可不少。每一件，都还很重要。