崔浩被诛灭九族有以下四个原因。
一.修史内容犯忌崔浩三朝元老，长期掌握权力，自以为是。最致命点是在续修史书中，对一些犯忌讳的记载没有进行修饰或处理，记载犯忌讳的内容是崔浩被杀的最根本原因。
二.用错人做错事崔浩修史中重用闵湛和郗标，导致做错事，后果不可收拾，直接造成被杀。《国记》修撰完成后，闵湛和郗标出于私心建议崔浩将新撰写的《国记》镌刻于石碑上，让天下人都可以看到。崔浩既然也同意了，让人将《国记》全部刻在石碑上并立于郊天坛东。汉人看了石碑上的内容，茶余饭后津津乐道。但是，鲜卑人看到了石碑上的忌讳内容，立马向太武帝报告，于是太武帝大恕下旨将崔浩满门抄斩，即著名的“国史之狱”。
三.得罪鲜卑贵族崔浩企图按照汉族的传统思想，重新调整氏族的尊卑，得罪了大部分鲜卑贵族是崔浩被杀灭族的一个主要原因。公元431年，崔浩“欲大整流品，明辨姓族”，其表弟卢玄劝阻他“创制立事，各有其时；乐意做这件事的人，能有几人！请你要三思。”但是崔浩没有听进去，此举得罪了众多的鲜卑贵族，从此走到鲜卑贵族的对立。
四.被疑怀有私心
太子拓跋晃监国时，崔浩向太子推荐多个自已的人做郡守，太子不同意，但是崔浩却力争到底，并如其所愿。事后太武帝得知很是不快，怀疑崔浩有私心，想独揽朝纲，到处安插自已人。此事后，太武帝心里疑其怀有私心，有了杀他的想法。
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