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海关行政许可，指海关根据公民、法人或者其他组织的申请，经依法审查，准予从事与海关进出境监督管理相关的特定活动的行为。
①合法原则；
②公开、公平、公正原则；
③便民原则。
(1)海关系统法律、行政法规设定的行政许可项目目录。
①报关企业的注册；②报关员资格核准及注册登记；③出口监管仓库、保税仓库设立审批；④进出境运输工具改、兼营境内运输审批；⑤海关监管货物仓储审批；⑥免税商店设立审批；⑦加工贸易备案(变更)外发加工、深加工结转、余料结转、核销、放弃核准；⑧进出口货物免验审批；⑨暂时进出口货物的核准；⑩报关单修改、撤销审批。
(2)以国务院决定方式公布的行政许可项目目录。
①海关派员驻厂监管的保税工厂的资格审批；②常驻机构及非居民长期旅客公私用物品进出境核准；③小型船舶往来香港、澳门进行货物运输备案；④承运境内海关监管货物的运输企业、车辆注册；⑤制造、改装、维修集装箱、集装箱式货车车厢工厂的核准；⑥外国在华常驻机构和常驻人员免税进境机动交通工具出售、转让或移作他用审批；⑦获准入境定居旅客安家物品审批；⑧进境货物直接退运核准；⑨高新技术企业适用海关便捷通关措施审批；⑩长江驳运船舶转运海关监管的进出口货物审批。
海关行政许可的归属管理部门是海关法制部门。
(1)海关总署法制部门。
主要承办下列事项：①对海关行政许可项目进行审查、登记、评估；②根据法律行政法规、海关总署规章的规定，收集、汇总、处理关于海关行政许可的立法建议；③受理、核实公民、法人、其他组织关于海关行政许可的申诉、举报、意见建议，解答咨询；④承办公民、法人、其他组织关于海关总署行政许可的行政复议、行政应诉案件，指导各级海关有关海关行政许可的行政复议、行政应诉等事宜；⑤对各级海关实施海关行政许可的情况进行监督检查；⑥指导、协调各级海关实施海关行政许可工作等。
(2)各直属海关法制部门。
①根据法律、法规、海关总署规章的规定，承办收集、汇总、上报关于海关行政许可的立法建议、本关区关于海关行政许可的实施情况等事宜；②受理、核实公民、法人、其他组织关于海关行政许可的申诉、举报、意见建议，解答咨询；③受理公民、法人、其他组织关于隶属海关实施海关行政许可的行政复议；④承办或指导公民、法人、其他组织关于本关区实施海关行政许可的行政应诉事宜；⑤对本关区实施海关行政许可的情况进行监督检查；⑥组织本关区关于海关行政许可的听证事宜等。
(1)以本海关的名义统一实施海关行政许可；
(2)海关内设机构和海关派出机构不得以自己的名义实施海关行政许可；
(3)海关可以根据规定委托其他海关或者其他行政机关实施，委托海关对后果承担法律责任，同时受托方不得再转委托；
(4)需要海关内设的多个机构办理的，该海关应当确定一个机构以海关名义统一受理，统一决定。
(1)法律、行政法规、海关总署规章规定海关实施行政许可应当听证的，海关应当举行听证。
(2)对直接关系公共资源配置、提供公共服务等涉及公共利益的重大行政许可事项，海关认为需要举行听证的，可以举行听证。
(3)海关行政许可直接涉及行政许可申请人予他人之间重大利益关系，行政许可申请人、利害关系人依法提出听证申请的，海关应当举行听证。
(1)申请与受理
申请人或其代理人可以到海关办公场所提出，也可以通过信函、电报、电传、传真、电子数据交换和电子邮件等方式提出书面申请。
(2)审查与决定
海关对申请人的申请进行审查，对申请材料齐全、符合法定形式，能够当场作出决定的，应当当场作出书面的海关行政许可决定，并当场制发决定书，加盖本海关印章，注明日期，同时不再印发“海关行政许可申请受理决定书”；不能当场作出决定的，应在法定的期限内作出海关行政许可决定。
(3)变更与延续
①变更。被许可人可以在该行政许可的有效期内，以书面的形式向作出准予海关行政许可决定的海关提出变更申请。
②延续。需要延续依法取得的海关行政许可的有效期内，被许可人应当在该行政许可有效期届满30日前向作出海关行政许可决定的海关提出书面申请，符合条件的准予延续。
(1)听证的准备
①听证的通知。海关应当于举行听证的7日前将有关事项通知海关行政许可申请人、利害人或者听证参加人。
②确定听证主持人。
(2)举行听证
①听证主持人宣布听证开始，并宣布听证事由等。
②宣布听证秩序。
a．审查海关行政许可申请的工作人员陈述审查意见和依据、理由，并提供相应的证据。
b．审查海关行政许可申请的工作人员、海关行政许可申请人、利害关系人或者听证参加人可以继续进行陈述。
C．听证主持人宣布听证结束。
在海关行政许可过程中，除当场做出海关行政许可决定的外，海关应当自受理海关行政许可申请之日起20日内做出决定。
20日内不能做出决定的，经审批，可以延长10日，并应制发《延长海关行政许可审查期限通知书》，将延长期限的理由告知申请人；依法应当先经下级海关审查后报上级海关决定的海关行政许可，下级海关应当依据法定条件和程序进行全面审查，并于受理海关行政许可申请之日起20日内审查完毕，将审查意见和全部申请材料直接报送上级海关，上级海关应当自收到下级海关报送的审查意见之日起20日内做出决定。
(1)将有力地推进海关依法行政工作，有利于建设现代海关制度，提高通关效率。
(2)便于海关管理相对人办理与海关行政许可有关的事宜，维护自己的合法权益。