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村级转移支付是指取消农业税附加后，各级财政支付给村级的专门用于村级干部报酬、农村五保户供养、办公经费等以保证村级组织正常运转所需要的经费资金。
为保障村级工作的正常运转，各级财政专门安排转移支付补助资金，确保村级补助资金和村级自有资金能够基本满足村干部报酬、农村五保户供养、办公经费等事项的需要。由此可见，村级转移支付资金对于保障村级政府基本公共服务均等化，促进农村社会和谐与稳定中发挥着十分重要的作用。
1．转移支付的规模太小
目前财政对村级转移支付仅限于村干部报酬、五保户供养、办公经费。对于村级公共卫生、社会治安、村级道路、农田水利、村民供水等基础性公共产品的供给尚处于空白，致使村级的公益性事业因财力不足无法开展，而村级公共产品的严重匮乏也制约了村级经济的迅速发展。
2．转移支付的形式、模式单一
目前中央和地方对村级的转移支付仅限于纵向的专项转移支付，横向、纵横交叉、一般转移支付都还是空白，使得农村基层政府提供基本服务的能力以及实现各地政府财力均等化的目标受到了限制。
3．专款分配缺乏公开性和透明性
由于区对村级专项转移支付管理办法没有公开或者公开性不够高，各村对专款是如何分配的，分配的标准是什么等都不十分清楚，只能从乡镇财政所了解本村获得了多少专款，村会计不清楚具体数额，容易导致村级年初编制财务收支预算表时漏计或者无法统计该资金，不利于村级统筹安排预算支出。
4．乡镇财政拨付资金不彻底，程序不规范
目前乡镇财政所对村级的转移支付补助资金实行专户存储，每年由乡镇财政所直接将村干部报酬拨付到村干部的工资卡上，然后由村会计直接将村干部报酬、报纸杂志、五保户补助等报销单据报送乡财政所进行列支。
1．增加对农村公共物品转移支付的力度
农村中的纯公共物品包括：农村基层政府管理、社会治安、计划生育、农业基础科研、农业环保、农村义务教育、农村公共卫生、社会救济等，建议将上述公共物品全部纳入预算支出范围，加大财政对于农村纯公共物品的投资。近年来，随着中央财政转移支付规模的不断扩大，村级提供公共产品的能力应保持在一个最低水平的公平范围内，从而保障村民享受公共服务方面最基本的权利。
2．增加转移支付形式，完善转移支付模式
为防止资金的渗漏，可减少中间的环节。譬如可尝试中央将资金拨付到省，省可以直接拨付到县，县可直接拨付到村。这样既可以减少中间环节主持资金的运作费用，又可以缩短资金的在途时间，提高资金的使用效率。
3．建立财政转移支付的法律体系
2012年我国中央的转移支付规模已达18791．52亿元，对如此一大笔资金的管理，迫切需要制定出台《转移支付法》，制定和完善《村级转移支付管理办法》，将村级转移支付的来源、计算方法、资金数额、资金划拨时间、程序等内容。在网上公开，为农业、民政、纪检等部门对村级的转移支付资金的使用、财务工作流程、财务公开进行监督检查提供法律依据。
4．加强资金的管理
财政部门要及时足额将村级转移支付资金拨付到乡镇村级代理中心的代管资金账户上，村级将其纳入“补助收入”科目进入村级账内进行核算，并且与村级自有资金一起在年初要编制预算并报代理中心备案，年终要及时编制决算。