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方案综合评价是在概略评价和详细评价的基础上，对整个创新方案的诸多因素作出全面、系统的评价。为此，首先要明确评价项目，即确定评价所需的各种指标和因素，然后分析各个方案对每一评价项目的满足程度；最后再根据方案对各评价项目的满足程度来权衡利弊，判断各方案的总体价值，从而选出总体价值最大的方案，即技术上先进、经济上合理和社会上有利的最优方案。
方案综合评价的方法有很多，常用的定性方法有德尔菲法、优缺点列举法等；常用的定量分析方法有直接评分法、加权评分法、比较价值评分法、环比评分法、强制评分法、几何平均值评分法等。
下面主要介绍以下几种：
1、优缺点列举法。把每一个方案在技术上、经济上的优缺点详细列出，进行综合分析，并对优缺点作进一步调查，用淘汰法逐步缩小考虑范围，从范围不断缩小的过程中找出最后的结论。
2、直接评分法。根据各种方案能够达到各项功能要求的程度，按照10分制或者百分制评分，然后算出每个方案达到功能要求的总分，比较各方案总分，作出采纳、保留、舍弃的决定，再对采纳、保留方案进行成本比较，最后确定最优方案。
3、加权评分法。这种方法是将功能、成本等各种因素，根据要求的不同进行加权计算，权数大小应根据它在产品中所处的地位而定．算出综合分数，最后对各方案寿命周期成本进行综合分析，选出最优的方案。主要步骤如下：
(1)确定评价项目及其权重系数；
(2)根据各方案对各评价项目的满足程度进行评分；
(3)计算各方案的评分权数和；
(4)计算各方案的价值系数，以较大为优。
方案经过评价。淘汰了不能满足要求的方案后，就可以从保留的方案中选择技术上先进、经济上合理和社会上有利的最优方案，方案评价和选优的方法可以参考对象选择的方法进行。