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投资部门结构是指投资资金在各部门之间的分配比例关系。国民经济可以分为众多的部门，主要有两大类，即物质生产部门和非物质生产部门。物质生产部门又可分为生产资料生产部门和消费资料生产部门，生产资料生产部门和消费资料生产部门还可进一步细分。把投资资金分配干不同的部门，形成不同层次的投资部门结构。
例如，投资资金在物质生产部门和非物质生产部门之间的分配，即形成生产性投资与非生产性投资的比例，这是一种较为粗放的投资部门结构，又如，投资资金在农业、工业、服务业等具体部门之间的分配，是从微观意义上而言的一种投资部门结构。
一般而言，随着生产力的发展和人均收入的提高，投资首先由第一产业向第二产业转移，再由第二产业向第三产业转移。在农业时代，第一产业投资比重占绝对优势，随着农业向工业化的转变，第一产业的投资比重逐渐下降，第二、三产业的投资比重逐渐提高。
投资部门结构演变的主要原因：