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存货短缺是指企业在存货采购过程中，由于供货单位少发、运输途中合理损耗以及运输部门原因，所造成的到货数量小于发票数量。
库存短缺，因为并不完全会使企业蒙受损失，再加上存货尚未入库，所以不需要通过“待处理财产损溢”核算。要分别情况进行处理：对于供货单位造成的存货短缺，如果尚未付款，付款时扣除短缺部分的数额就可以了；如果已经付款，应通过“其他应收款”核算。然后追索货款或通知供货单位补充发货。对于运输途中的合理损耗，在总分类帐中不必进行处理，只需要在明细帐中调整实收数量与购人单价就可以了。对于运输单位造成的短缺，先通过“其他应收款”核算，同时向运输单位索赔。
【例】丙企业从外地C公司购进玻璃烧杯一批，共600个，单价2O元。C公司开来增值税专用发票，价款12000元，增值税2040元。同时转来普通发票一张，代垫运费2000元。丙企业通过银行支付了上述款项。烧杯到货后，经验收发现C公司少发10个，运输过程中打碎3O个。根据有关凭证编制会计分录如下：
1．支付货款时
借：材料采购——烧杯13800(02000+2000×90%)应交税金——应交增值税(进项税额)2240(2040+2000×10%)
贷：银行存款16040
2．验收入库时
借：低值易耗品——烧杯12880
(13800/6O0×560)
其他应收款——C公司230
(13800/600×10)
——× ×运输部门690
(13800/600×30)
贷：材料采购——烧杯13800
【又例】丁企业从D煤矿购进原煤3000吨，用火车运回。每吨煤单价200元，共计货款600000元，增值税款102000元，另支付运费5000元。煤到货检斤后，发现短缺1吨，经查属定额内合理损耗，所有款项均已支付。根据有关凭证处理如下：
1．支付货款时
借：材料采购——原煤604500
(600000+ 5000×90%)
应交税金——应交增值税(进项税额)1O25O0
(102000+ 5000×10%)
贷：银行存款707000
2．验收入库时
借：原材料——原煤604500
贷：材料采购——原煤604500
3．对于原煤的合理损耗在其明细帐中的反映，根据入库单做如下记载：
| 材料名称：原煤 | |||||||||||
| 存放地点：6号仓库 | 计量单位：吨 | ||||||||||
| **年 | 摘 要 | 收 入 | 支 出 | 结 存 | |||||||
| 月 | 日 | 数量 | 单价 | 金额 | 数量 | 单价 | 金额 | 数量 | 单价 | 金额 | |
| 5 | 1 | 期初结存 | 5 | 220 | 1100 | ||||||
| 5 | 3 | 购 入 | 2999 | 201.57 | 604500 | ||||||
注：如果没有这1吨损失的话，该批购人原煤的单价=604500/3000=2O1.50(元)。
损失后的平均单价=604500/2999=201.57(元)，平均每吨煤上升了0.07元。